结论：离职单上“其他原因”写按档案退休，一般不算自动离职，但具体是否构成自动离职需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、自动离职的定义与判断

自动离职通常指的是劳动者未按照法律规定或劳动合同约定，未经用人单位同意，擅自离开工作岗位的行为。判断是否构成自动离职，关键在于劳动者是否未经许可擅自离职，以及是否因此给用人单位造成了损失。在您描述的情况下，离职单上明确填写了“按档案退休”作为离职原因，这表明离职是出于退休这一合法且正当的理由，而非擅自离职。

二、退休与自动离职的区别

1. 退休：退休是劳动者达到法定退休年龄或符合其他退休条件时，依法享受养老保险待遇并终止劳动关系的行为。退休是劳动者的合法权益，受到法律保护。
2. 自动离职：如前所述，自动离职是劳动者未经许可擅自离职的行为，通常伴随着对用人单位的违约和损害。

在您的情况下，由于离职原因是退休，且已经按照档案退休的程序进行了办理，因此不符合自动离职的特征。

三、可能存在的争议点

尽管一般情况下按档案退休不算自动离职，但仍需注意以下可能存在的争议点：

1. 离职单的填写与确认：如果离职单上的“按档案退休”是劳动者自行填写，且未经用人单位确认或同意，而用人单位又主张劳动者是自动离职的，可能会引发争议。此时，需要审查离职单的填写过程、双方沟通记录等证据，以确定离职的真实原因。
2. 退休手续的办理：如果劳动者虽然填写了“按档案退休”作为离职原因，但实际上并未按照法定程序办理退休手续，或者退休手续存在瑕疵的，也可能影响对离职性质的判断。

四、法律建议

1. 保留证据：为了确保自己的权益不受损害，建议您保留好离职单、退休手续办理记录等相关证据，以备不时之需。
2. 与用人单位沟通：如果与用人单位在离职性质上存在争议，建议及时与用人单位进行沟通，明确双方的权利和义务，避免不必要的法律纠纷。
3. 寻求法律帮助：如果争议无法通过沟通解决，您可以向我咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。

总结：离职单上“其他原因”写按档案退休，一般不算自动离职。但具体是否构成自动离职，还需结合离职单的填写与确认情况、退休手续的办理情况等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。