农民工专户代发工资与建立劳动合同之间并不冲突，农民工专户代发工资并不影响劳动合同的建立。以下从几个方面进行详细分析：

一、劳动合同的建立基础

劳动合同的建立主要基于劳动者与用人单位之间的合意，即双方就工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等条款达成一致意见，并签订书面合同。这一过程中，工资的支付方式（如现金、银行转账、专户代发等）并不是决定劳动合同是否建立的关键因素。

二、农民工专户代发工资的性质

农民工专户代发工资是一种工资支付方式，旨在保障农民工的工资权益，防止工资被拖欠或挪用。这种支付方式通常由政府或相关部门监管，确保工资按时、足额发放到农民工手中。它并不改变劳动者与用人单位之间的劳动关系，也不影响劳动合同的效力。

三、农民工专户代发工资与劳动合同的关系

1. 不冲突性：农民工专户代发工资与劳动合同的建立并不冲突。即使采用专户代发工资的方式，用人单位仍然需要与农民工签订劳动合同，明确双方的权利和义务。
2. 相互促进：专户代发工资可以作为一种保障措施，增强农民工对用人单位的信任，从而促进劳动合同的顺利签订和履行。同时，劳动合同的签订也为专户代发工资提供了法律依据和保障。

四、实际操作中的注意事项

1. 确保合同签订：无论采用何种工资支付方式，用人单位都应与农民工签订书面劳动合同，明确工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等关键条款。
2. 遵守法律法规：用人单位在采用专户代发工资方式时，应遵守相关法律法规和政策规定，确保工资的按时、足额发放。
3. 保留证据：农民工应妥善保管与用人单位签订的劳动合同以及工资发放记录等证据，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。

五、法律后果

如果用人单位未与农民工签订劳动合同或未按时、足额发放工资（包括通过专户代发的方式），农民工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位承担相应的法律责任。这包括支付未签订劳动合同的双倍工资差额、补发拖欠的工资以及支付经济补偿金等。

总结来说，农民工专户代发工资并不影响劳动合同的建立。用人单位应依法与农民工签订劳动合同，并遵守相关法律法规和政策规定，确保工资的按时、足额发放。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。