非医师行医的违法所得是包含工资的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律定义与构成
根据《中华人民共和国医师法》及相关法律法规，非医师行医是指未取得医师执业资格的人擅自从事医疗活动的行为。违法所得，通常指的是行为人通过违法行为所获得的全部收入，包括但不限于诊疗费、药品费、检查费等直接收入，以及因行医行为而获得的间接收入，如工资、奖金等。
二、工资作为违法所得的合理性
工资的性质：工资是劳动者因提供劳动而获得的报酬。在非医师行医的情境中，行医者虽然可能以某种形式（如雇佣关系）获得工资，但由于其行医行为本身是违法的，因此这种工资收入也构成了违法所得的一部分。
法律逻辑：从法律逻辑上讲，如果允许非医师行医者保留其因行医行为而获得的工资，那么这将是对违法行为的变相鼓励，不利于维护医疗市场的秩序和患者的权益。因此，将工资纳入违法所得的范围，是符合法律精神和立法目的的。
三、实际案例与司法实践
在实际案例中，法院在判决非医师行医案件时，通常会将行医者因行医行为而获得的全部收入，包括工资，都认定为违法所得，并依法予以没收。这一做法体现了法律对非医师行医行为的严厉打击态度，也维护了医疗市场的公平和秩序。
四、法律后果与建议
法律后果：非医师行医不仅可能导致违法所得被没收，还可能面临罚款、行政拘留甚至刑事处罚等严重后果。因此，任何未取得医师执业资格的人都应严格遵守法律法规，不得擅自从事医疗活动。
建议：对于已经从事或计划从事医疗活动的人，应首先确保自己具备合法的医师执业资格。如果因各种原因无法取得执业资格，则应寻求合法的途径和方式来提供医疗服务，如加入合法的医疗机构或与合法医师合作等。
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