国企行政警告处分三年后，若处分期间无新违规行为且表现良好，通常处分影响自然消除，不影响晋升、薪酬等；若期间有新违规或表现不佳，可能面临处分延长或加重。以下为详细分析：

1. 处分影响期满后的自然消除
   根据《国有企业领导人员廉洁从业若干规定》及企业内部规章制度，行政警告处分的影响期一般为6个月至1年（具体期限需以企业内部规定为准，但最长不超过1年）。若题目中“三年”为实际影响期（可能因企业特殊规定或多次违规叠加），则需明确：若员工在处分影响期内未再发生违规行为，且工作表现符合考核要求，处分影响期满后，处分决定自动失效，不再对员工的晋升、薪酬、评优等产生限制。企业应依据规定恢复其原有待遇或资格。

2. 处分影响期内的表现评估
   若员工在三年处分影响期内：

• 无新违规行为：企业应按期解除处分，并书面通知员工；
  
• 有新违规行为：企业可依据《劳动合同法》及内部规定，延长处分期限、升级处分类型（如从警告升级为记过），甚至解除劳动合同；
  
• 表现优异：部分企业可能提前解除处分（需内部制度明确授权），但需履行民主程序（如职代会审议）并公示。

1. 处分记录的后续处理
   根据《企业职工奖惩条例》（虽已废止，但部分企业仍参照）及劳动法精神，处分记录一般不纳入员工人事档案的永久内容，但企业可保留内部管理台账。若员工后续申请调岗、晋升或离职，企业可依据内部规定要求其说明处分情况，但不得以此为由歧视员工。

2. 争议解决路径
   若员工认为处分决定违法或程序不当，可：

• 内部申诉：向企业工会或纪检监察部门提出书面异议；
  
• 劳动仲裁：以“企业违法解除或处分”为由申请仲裁，要求撤销处分或赔偿；
  
• 诉讼：对仲裁结果不服的，可向法院提起民事诉讼。

建议：员工若对处分决定有异议，应首先查阅企业内部《员工手册》或《奖惩制度》，确认处分依据及程序是否合规；若企业未履行告知义务或处分明显不当，可依法维权。如有具体案例或细节需进一步分析，可直接向我咨询。