在刑事没收的公司房产法院拍卖时，卖方税费的承担问题，通常遵循以下原则和规定：
税费承担的一般原则：
- 在房产拍卖过程中，税费的承担一般遵循“谁受益，谁承担”的原则。然而，在刑事没收的公司房产拍卖中，由于房产的原所有权已经因刑事没收而转移至国家或相关机构，因此，严格意义上讲，并不存在传统意义上的“卖方”。但为便于理解，我们可以将执行拍卖的法院或相关机构视为代表国家行使处分权的“卖方”。
- 实际操作中，由于拍卖所得款项往往需要用于偿还债务、支付执行费用等，且刑事没收本身已是对原所有权人的一种惩罚，因此，通常不会要求原所有权人（或已不存在的公司）承担拍卖过程中的税费。相反，这些税费往往由拍卖所得款项中优先支付，或者根据法院的判决、裁定来确定具体的承担方。
具体税费承担情况：
- 增值税及附加：如果房产在拍卖时符合增值税的征税条件（如非住宅类房产且持有时间不足一定年限），则可能需要缴纳增值税及附加。这部分税费通常由买方承担，但具体由哪方承担也可能根据拍卖公告或法院裁定来确定。不过，在刑事没收房产的拍卖中，更常见的是由拍卖所得款项中直接扣除。
- 契税：契税是买方在购买房产时需要缴纳的税费，其税率和计算方式因地区而异。在刑事没收房产的拍卖中，契税通常由买方承担。
- 其他税费：如印花税、土地增值税等，这些税费的承担也可能根据具体情况和法院裁定来确定。在大多数情况下，这些税费同样会由拍卖所得款项中优先支付或根据法院裁定来分配。
特殊情况下的税费承担：
- 如果拍卖公告或法院裁定中明确规定了税费的承担方，那么应严格按照公告或裁定来执行。例如，法院可能裁定由买方承担全部税费，或者由拍卖所得款项中支付特定税费等。
- 在某些特殊情况下，如果原所有权人（或已不存在的公司）在刑事案件中存在过错或违法行为，且该过错或违法行为与房产的没收和拍卖有直接关联，那么法院可能酌情判决由原所有权人（或其相关责任人）承担部分或全部税费。但这种情况较为罕见，且需要具体的法律依据和事实支持。
法律建议：
- 对于参与刑事没收公司房产拍卖的买方而言，在参与拍卖前应仔细阅读拍卖公告和法院裁定，了解税费的具体承担情况和相关规定。
- 如果对税费承担有疑问或争议，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取准确的法律意见和帮助。
总结：刑事没收的公司房产在法院拍卖时，卖方税费的承担问题通常根据拍卖公告、法院裁定以及相关法律法规来确定。在大多数情况下，税费会由拍卖所得款项中优先支付或根据法院裁定来分配。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师。