将一类农田改为三类农田是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
一、合法变更的情况
如果一类农田的变更行为符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定，且经过了合法的审批程序，那么这种变更就是合法的。具体来说，可能涉及以下几种情况：
- 土地利用总体规划调整：根据土地利用总体规划，一类农田可能因规划调整而需要变更为三类农田。这种情况下，只要调整符合规划要求，并经过了相关部门的审批，就是合法的。
- 农业结构调整：为了优化农业结构，提高农业生产效益，可能需要对农田进行类型调整。如果这种调整符合农业结构调整的政策要求，并经过了相关部门的批准，也是合法的。
- 土地整治项目：在土地整治项目中，可能需要对农田进行改造和升级，包括农田类型的变更。只要项目符合土地整治的规划和要求，并经过了合法的审批程序，这种变更也是合法的。
二、违法变更的情况
如果一类农田的变更行为违反了土地利用总体规划、相关法律法规的规定，或者未经合法审批程序，那么这种变更就是违法的。具体来说，可能涉及以下几种情况：
- 未经批准擅自变更：未经相关部门批准，擅自将一类农田变更为三类农田，这种行为是违法的。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。虽然此条款主要针对的是农用地改为建设用地，但擅自变更农田类型同样可能触犯相关法律，面临类似的法律责任。
- 违反规划变更：虽然经过了审批，但变更行为违反了土地利用总体规划的要求，这种变更也是违法的。土地利用总体规划是土地管理和利用的重要依据，任何变更行为都必须符合规划要求。
- 破坏耕地质量：在变更过程中，如果破坏了耕地的质量，导致耕地无法继续用于农业生产，这种行为也是违法的。耕地是农业生产的基础，保护耕地质量是维护国家粮食安全的重要措施。
三、法律建议
- 了解相关法律法规：在进行农田类型变更前，应充分了解相关法律法规和政策要求，确保变更行为合法合规。
- 申请审批程序：如果需要进行农田类型变更，应按照规定的程序向相关部门申请审批，并获得批准后再进行变更。
- 保护耕地质量：在变更过程中，应采取有效措施保护耕地质量，避免对耕地造成破坏。
如果您有具体的农田变更情况或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。