诈骗罪员工是否有案底，主要取决于其是否构成诈骗罪并被法院定罪判刑。以下是对这一问题的详细分析：
构成诈骗罪并留下案底的情况：
- 明知故犯：如果员工在诈骗公司上班，明知公司从事诈骗活动仍然积极参与，或直接实施了诈骗行为，并且达到了诈骗罪的定罪标准，经人民法院审判后被认定构成诈骗罪，被判处刑罚（包括管制、拘役、有期徒刑等主刑，以及罚金、剥夺政治权利等附加刑），则会留下案底。这是因为员工的行为已被认定为刑事犯罪，并受到了相应的刑事处罚。
- 共犯情况：即使员工只是负责辅助性工作，如拨打电话、发送虚假信息等，但如果主观上明知是在实施诈骗行为，且该行为在整个诈骗犯罪活动中起到了一定作用，也可能被认定为诈骗罪的共犯，从而留下案底。
不构成诈骗罪或不留下案底的情况：
- 不知情参与工作：如果员工确实不知道公司在从事诈骗活动，只是按照正常的工作安排履行职责，没有主观上的故意，也没有实施诈骗的客观行为，那么就不构成诈骗罪，不会留下案底。
- 情节显著轻微：有些人虽然参与了公司的一些活动，但情节显著轻微、危害不大，根据《中华人民共和国刑法》第十三条的规定，不认为是犯罪。这种情况下也不会留下案底。例如，只是临时被安排做了一些边缘性、辅助性且未造成实际危害后果的工作，并在发现异常后及时停止参与。
- 未达到定罪标准：即使有一定的参与行为，但没有达到诈骗罪的立案追诉标准（一般来说，诈骗公私财物价值三千元至一万元以上属于“数额较大”），也不会被认定为犯罪，自然也不会留下案底。
案底的影响：
- 案底，即犯罪人员犯罪记录制度，是指某人过去犯罪行为的记录。在我国，这通常指有过刑事犯罪前科的档案记录，该犯罪档案一般存放于公安部门及相关国家机关。
- 一旦留下案底，将对个人产生深远影响，包括但不限于就业受限（特别是在金融机构、大型企业等对员工诚信要求较高的单位）、社会信用评级下降（可能在信贷、租房、购买保险等事务中受到限制）、生活出行受限（如可能被限制出境）以及再次犯罪时可能面临的从重处罚等。
建议：
- 无论身处何种工作环境，都应遵守法律法规，避免参与任何违法犯罪活动，以免给自己留下不良记录。
- 如果发现自己所在的公司或单位存在违法犯罪行为，应及时向公安机关报案，并保护好自己的合法权益。
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