结论：签三方合同不写中介公司的营业执照注册号，虽然合同本身可能仍然有效，但会带来一定的法律风险和不便。建议尽量在合同中明确中介公司的营业执照注册号，以确保合同的完整性和安全性。
分析说明：
合同效力不受直接影响：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的效力主要取决于合同双方的意思表示是否真实、合同内容是否合法以及是否违反了法律、行政法规的强制性规定。营业执照注册号并非合同生效的必备要素，因此，即使合同中未写明中介公司的营业执照注册号，合同本身仍然可能具有法律效力。
可能带来的法律风险和不便：
- 身份确认困难：营业执照注册号是中介公司身份的重要标识，未写明可能导致在合同履行过程中或发生纠纷时，难以准确确认中介公司的身份，进而影响合同的履行和纠纷的解决。
- 增加维权成本：如果因中介公司的原因导致合同无法履行或产生纠纷，未写明营业执照注册号可能使得受害方在维权过程中需要花费更多时间和精力去调查中介公司的真实身份和资质，从而增加维权成本。
- 影响合同信誉：一份完整、规范的合同应当包含所有必要的信息，包括中介公司的营业执照注册号。未写明可能使得合同显得不够规范，进而影响合同的信誉和双方的信任度。
建议措施：
- 尽量明确营业执照注册号：在签订三方合同时，应尽量要求中介公司提供其营业执照注册号，并将其明确写入合同中。这有助于确保合同的完整性和安全性，降低法律风险和不便。
- 核实中介公司资质：在签订合同前，应对中介公司的资质进行核实，包括查看其营业执照、经营许可证等相关证件，以确保其具备从事相关业务的合法资质。
- 咨询专业律师：如果对合同内容或签订过程存在疑问或担忧，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议和指导。
后续行动指南：
- 如果已经签订了未写明中介公司营业执照注册号的三方合同，且合同尚未履行或正在履行过程中，建议尽快与中介公司协商补充相关信息，以确保合同的完整性和安全性。
- 如果因中介公司的原因导致合同无法履行或产生纠纷，且合同中未写明营业执照注册号，应尽快收集其他能够证明中介公司身份和资质的证据，如中介公司的宣传资料、业务往来记录等，以便在维权过程中使用。
如有任何合同纠纷或公司法务方面的疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和指导。