针对员工（特别是领导干部）未上报亲属经商办企业的情况，这是一个涉及廉洁纪律和职务行为规范的重要问题，需要依据相关规定进行严肃处理。以下是根据相关法规和条例，对此类问题的详细解答：

一、处理原则

首先，必须明确的是，员工（尤其是领导干部）有义务如实报告其亲属的经商办企业情况，这是维护组织廉洁、防止利益冲突的重要措施。对于未上报的情况，应依据相关法规和条例进行严肃处理，以维护组织的纪律性和公正性。

二、具体处理措施

1. 调查核实：

   • 一旦发现员工未上报亲属经商办企业的情况，应立即启动调查程序，核实相关事实。
   • 调查应全面、客观、公正，确保事实清楚、证据确凿。

2. 分类处置：

   • 若员工利用职权或职务影响为亲属经商办企业提供便利或谋取私利：
     • 根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，认定为违反廉洁纪律。
     • 视情节轻重，给予党内警告直至开除党籍处分。
     • 若涉嫌受贿犯罪，移送司法机关处理。
   • 若员工未利用职权或职务影响，但纵容、默许亲属利用其职权或职务影响违规经商办企业：
     • 同样认定为违反廉洁纪律。
     • 视情节轻重，给予相应的党纪政纪处分。
   • 若员工未利用职权或职务影响，但亲属在其管辖的地区和业务范围内从事可能影响其公正执行公务的经营活动：
     • 责令员工予以纠正，督促亲属停止违规经商办企业行为或调整经营范围、退出相关企业。
     • 若员工拒不纠正，可提出由员工辞去现任职务或由组织部门予以调整职务的处理建议。
     • 若员工既不纠正也不辞去现任职务或不服从组织调整职务，给予撤销党内职务处分。

3. 利益处置：

   • 对于违规经商办企业所获利益，应作为违纪所得予以收缴。
   • 若无法准确计算数额，可依据员工交代的盈利情况，在其自愿上交相关财物后按登记上交处理。
   • 对于违规取得的特许经营权等其他利益，应由纪检监察机关建议相关单位、部门予以撤销或纠正。

4. 隐瞒不报的处理：

   • 若员工违反个人有关事项报告规定，隐瞒不报亲属经商办企业情况，视情给予党内警告或严重警告处分。
   • 但需注意避免重复评价，若瞒报行为系上游违纪问题的自然延续，且要求其主动报告、暴露自身违纪问题缺乏期待可能性，一般不宜将隐瞒不报告违规经商办企业的行为重复认定为违反组织纪律。

三、预防措施

1. 加强教育：

   • 定期对员工进行廉洁纪律教育，提高其对亲属经商办企业报告义务的认识。
   • 通过案例分析、警示教育等方式，增强员工的廉洁自律意识。

2. 完善制度：

   • 建立健全亲属经商办企业报告制度，明确报告内容、方式和时限。
   • 加强对报告情况的审核和监督，确保报告的真实性和准确性。

3. 强化监督：

   • 纪检监察机构应加强对员工亲属经商办企业情况的监督检查，及时发现和纠正违规行为。
   • 鼓励员工之间相互监督，形成良好的廉洁氛围。

综上所述，对于员工未上报亲属经商办企业的情况，应依据相关法规和条例进行严肃处理，同时加强教育、完善制度和强化监督，以维护组织的廉洁性和公正性。