工程款支付了90%的情况下，一般不能直接认定拒不支付劳动报酬罪，但具体还需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、拒不支付劳动报酬罪的构成要件
拒不支付劳动报酬罪，是指以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动者的劳动报酬或者有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的行为。要构成此罪，需同时满足以下几个要件：
- 主观方面：故意逃避支付劳动者的劳动报酬，即明知自己应当支付劳动者的劳动报酬，而采取转移财产、逃匿等方法逃避支付。
- 客观方面：
- 实施了转移财产、逃匿等逃避支付劳动报酬的行为；
- 有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，且数额较大；
- 经政府有关部门责令支付仍不支付。
二、工程款支付90%的情况分析
在工程款已经支付了90%的情况下，要认定拒不支付劳动报酬罪，需考虑以下几个方面：
剩余款项的性质：
- 如果剩余的10%款项是因合同纠纷、工程质量问题等合理原因而暂未支付，且支付方有合理的支付计划和安排，那么一般不构成拒不支付劳动报酬罪。
- 如果剩余款项是支付方故意拖欠，且数额较大（具体数额标准需根据当地经济发展水平、劳动者人数等因素综合判断），同时支付方有能力支付而拒不支付，且经政府有关部门责令支付仍不支付的，那么可能构成拒不支付劳动报酬罪。
支付方的支付能力：
- 如果支付方确实存在资金困难等客观原因，导致无法按时支付剩余款项，且支付方正在积极筹措资金或采取其他措施解决支付问题，那么一般不构成拒不支付劳动报酬罪。
- 如果支付方有能力支付而拒不支付，且采取转移财产、逃匿等逃避支付的行为，那么可能构成拒不支付劳动报酬罪。
政府有关部门的责令支付情况：
- 如果政府有关部门已经责令支付方支付剩余款项，且支付方在规定期限内仍未支付，那么可能构成拒不支付劳动报酬罪。
- 如果政府有关部门尚未责令支付，或者支付方在责令支付后已经积极采取措施支付剩余款项，那么一般不构成拒不支付劳动报酬罪。
三、建议与措施
协商与调解：
- 在工程款支付问题上，双方应首先尝试通过协商和调解的方式解决争议。这可以节省时间和成本，同时维护双方的友好关系。
申请仲裁或提起诉讼：
- 如果协商和调解无果，支付方或接收方可以申请仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。在申请仲裁或提起诉讼时，应提供充分的证据来证明自己的主张。
关注政府有关部门的责令支付情况：
- 如果支付方存在拖欠工程款的行为，接收方可以向政府有关部门投诉举报，要求其对支付方进行监管和责令支付。如果支付方在规定期限内仍未支付，那么可能构成拒不支付劳动报酬罪。
咨询专业律师：
- 在处理工程款支付问题时，如果涉及复杂的法律关系和争议点，建议咨询专业律师以获得更具体的法律建议和帮助。不过，作为王慎云律师，我随时准备为你提供法律咨询，你可以直接向我提问。
综上所述，工程款支付了90%的情况下，一般不能直接认定拒不支付劳动报酬罪。但具体还需结合实际情况判断支付方是否存在故意拖欠、有能力支付而不支付等行为，以及政府有关部门的责令支付情况等因素。