结论：交房后开发商要调整地下负二商场为商业用途是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及规划变更、合同约定及业主权益保护等方面。以下从不同角度详细分析：

一、规划变更的合法性

1. 规划变更的法定程序：

   • 根据《城乡规划法》等相关法律法规，开发商若需变更已批准的规划，必须向城乡规划主管部门提出申请，并经过法定程序审批。未经批准擅自变更规划的，属于违法行为。
   • 若开发商已依法获得规划变更的批准，且变更内容符合相关法律法规和规划要求，则其调整地下负二商场为商业用途的行为在规划层面可能是合法的。

2. 规划变更对业主的影响：

   • 规划变更可能影响业主的居住环境、交通出行、公共设施使用等方面。若变更导致业主权益受损，业主有权依法提出异议并要求赔偿。
   • 业主应关注开发商是否就规划变更进行了充分公示，并听取了业主的意见。若开发商未履行相关程序，业主可向相关部门投诉或寻求法律救济。

二、合同约定的效力

1. 购房合同中的相关条款：

   • 业主在购房时，应仔细审查购房合同中关于房屋用途、规划变更等方面的条款。若合同中明确约定了地下负二层的用途，且开发商未经业主同意擅自变更，则构成违约。
   • 若合同中未明确约定或约定模糊，则需根据相关法律法规和行业惯例进行判断。

2. 业主的维权途径：

   • 若开发商违反合同约定，业主可依据合同条款要求开发商承担违约责任，包括赔偿损失、恢复原状等。
   • 业主也可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。在维权过程中，业主应保留好相关证据，如购房合同、规划变更通知、业主大会决议等。

三、业主权益的保护

1. 业主大会的决策权：

   • 根据《物业管理条例》等相关法律法规，业主大会是业主行使共同管理权的机构。若开发商的规划变更涉及业主共同利益，应提交业主大会讨论并表决。
   • 业主大会的决策对全体业主具有约束力。若开发商未履行相关程序，业主可要求开发商停止变更行为并恢复原状。

2. 政府部门的监管职责：

   • 城乡规划主管部门、住房和城乡建设部门等政府机构对开发商的规划变更行为负有监管职责。若开发商存在违法行为，政府部门应依法进行处罚并责令整改。
   • 业主可向相关部门投诉或举报开发商的违法行为，并要求政府部门进行调查处理。

四、具体建议

1. 核实规划变更的合法性：

   • 业主可向城乡规划主管部门查询开发商是否已依法获得规划变更的批准，并了解变更内容是否符合相关法律法规和规划要求。

2. 审查购房合同条款：

   • 业主应仔细审查购房合同中关于房屋用途、规划变更等方面的条款，并了解自己的权利和义务。

3. 积极参与业主大会：

   • 业主应积极参与业主大会的讨论和表决，行使自己的共同管理权，维护自己的合法权益。

4. 寻求法律救济：

   • 若开发商存在违法行为或违反合同约定，业主可依法寻求法律救济，包括协商、调解、仲裁或诉讼等方式。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更详细、更专业的法律建议。