结论前置：部门主管个人报销让您代为申请是否合规，需结合公司内部规章制度、报销流程以及是否存在利益冲突或违规操作等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 公司内部规章制度角度：

   • 合规性基础：首先，应查阅公司内部的财务管理制度或报销政策，看是否有明确规定员工报销的申请流程、审批权限以及是否允许他人代为申请。若制度中明确规定了报销需本人亲自申请，或对代为申请有特定限制（如需授权委托书等），则部门主管让您代为申请可能违反公司规定。
   • 实际操作建议：若公司制度未明确禁止代为申请，但通常实践中鼓励或要求本人申请，建议您与部门主管沟通，了解其无法亲自申请的原因，并评估是否符合公司文化及实际操作惯例。若确实存在合理原因（如出差、病假等），且公司制度未明确禁止，可考虑在获得适当授权后代为申请。

2. 利益冲突与违规操作角度：

   • 潜在风险：即使公司制度未明确禁止代为申请，若部门主管的报销行为存在虚假报销、夸大费用等违规操作，您代为申请可能无意中成为其违规行为的共犯或协助者，从而面临法律风险。
   • 防范措施：在代为申请前，应确保报销事项真实、合理，并保留好相关证据（如发票、合同、审批单等）。同时，建议与部门主管明确沟通，确保其了解报销的合规性要求，并承诺报销事项的真实性。若发现任何违规迹象，应立即拒绝代为申请，并向公司相关部门报告。

3. 法律责任角度：

   • 民事责任：若因代为申请报销导致公司遭受损失（如因虚假报销被税务机关处罚、因违规操作被合作伙伴索赔等），您可能因未尽到合理注意义务而承担一定的民事赔偿责任。
   • 刑事责任：在极端情况下，若代为申请报销的行为构成共同犯罪（如与部门主管共同实施虚假报销、贪污等犯罪行为），您可能面临刑事责任的追究。
   • 合规建议：为避免法律责任，建议您在代为申请报销前，充分了解报销事项的合规性，确保所有操作均符合公司制度及法律法规要求。同时，保留好相关证据，以备不时之需。

综合建议：在决定是否代为申请部门主管的个人报销时，您应首先查阅公司内部的财务管理制度或报销政策，了解相关规定及流程。若制度未明确禁止且存在合理原因，可考虑在获得适当授权后代为申请，但务必确保报销事项的真实性和合规性。若存在任何疑虑或违规迹象，应立即拒绝代为申请，并向公司相关部门报告。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。