结论概述：员工投资后辞职，其股份能否继续持有取决于多种因素，包括公司章程、股东协议、投资协议的约定以及相关法律法规的规定。以下将从不同角度进行详细分析。
一、公司章程与股东协议的约定
公司章程规定：
- 公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的组织结构、股东权利与义务等重要事项。如果公司章程中明确规定了员工离职后股份的处理方式，如必须转让、可以保留等，那么员工应遵守公司章程的规定。
- 示例：若公司章程规定，员工离职后必须将其持有的股份转让给公司或其他股东，那么员工在离职后就不能继续持有股份。
股东协议约定：
- 股东协议是股东之间就公司经营、管理、利润分配等事项达成的协议。如果股东协议中有关于员工离职后股份处理的特别约定，员工也应遵守。
- 示例：股东协议可能规定，员工离职后，其持有的股份在一定期限内（如一年）内不得转让，或者必须以特定价格转让给其他股东。
二、投资协议的约定
- 如果员工是通过投资协议成为公司股东的，那么投资协议中也会对股份的转让、退出等事项进行约定。员工在离职时，应依据投资协议的约定来处理其持有的股份。
- 示例：投资协议可能规定，员工在离职后，其持有的股份可以按照公司当时的估值进行转让，或者必须转让给公司指定的第三方。
三、相关法律法规的规定
《公司法》相关规定：
- 根据《公司法》的规定，股东有权依法转让其股权。但是，如果公司章程或股东协议对股权转让有特别限制，股东应遵守这些限制。
- 法律条款：《公司法》第七十一条：“有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。”
其他相关法律法规：
- 除了《公司法》外，还可能涉及《证券法》、《合同法》等相关法律法规的规定。这些法律法规可能对股份的转让、退出等事项有进一步的规范。
四、实际操作建议
审查相关文件：
- 员工在离职前，应仔细审查公司章程、股东协议、投资协议等相关文件，了解其中关于股份处理的规定。
与公司协商：
- 如果相关文件对股份处理没有明确规定或规定不明确，员工可以与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
寻求法律帮助：
- 如果员工与公司之间无法就股份处理达成一致意见，员工可以寻求法律帮助，通过法律途径解决争议。
五、可能面临的法律后果
- 如果员工违反公司章程、股东协议或投资协议的约定，擅自处理其持有的股份，可能会面临违约责任、赔偿损失等法律后果。
- 如果员工的处理行为违反了相关法律法规的规定，还可能面临行政处罚或刑事责任。
总结与建议：员工投资后辞职，其股份能否继续持有并不是一个简单的问题，它取决于多种因素的综合考虑。因此，建议员工在离职前仔细审查相关文件，与公司进行充分协商，并在必要时寻求法律帮助，以确保自己的权益得到妥善保护。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。