实控人被留置期间，其持有的股票处理需分情况讨论，核心结论如下：

1. 股票性质为个人财产且未被冻结
   若实控人持有的股票属于其个人合法财产（如通过二级市场购买），且未因案件被司法机关冻结、查封，理论上其仍享有股东权利（如分红权、表决权）。但留置期间实控人人身自由受限，无法亲自行使权利，需通过书面授权委托他人代为行使（如配偶、子女或律师），或依据公司章程提前设置表决权代理机制。
   风险提示：若股票涉及利益输送、内幕交易等违法所得，司法机关可能依法追缴或冻结，此时需配合调查并等待司法程序结果。

2. 股票因案件被司法冻结或强制执行
   若实控人因涉嫌职务犯罪、经济犯罪等被留置，其名下股票可能被公安机关、检察院或法院依法冻结（如《刑事诉讼法》第144条），或因债务纠纷被法院强制执行（如《民事诉讼法》第249条）。此时：

   • 冻结期间：股票不得转让、质押或设置其他权利负担，但分红权可能仍归属实控人（需根据冻结裁定具体内容判断）；
     
   • 强制执行阶段：若案件进入执行程序，法院可能通过拍卖、变卖等方式处置股票，所得款项用于清偿债务或上缴国库（如涉及贪污贿赂等犯罪）。
     操作建议：实控人或其家属可向办案机关提交财产合法性证明（如购股资金来源），申请解除冻结或参与执行异议程序。

3. 股票属于上市公司实控人且涉及信息披露义务
   若实控人为上市公司控股股东，其被留置可能触发《证券法》第80条规定的“重大事件披露义务”。此时：

   • 上市公司需在2个交易日内披露实控人被留置信息，说明留置原因、涉及主体及可能影响；
     
   • 若实控人未履行披露义务，可能面临证监会行政处罚（如警告、罚款），情节严重者可能涉及刑事责任（如违规披露、不披露重要信息罪）。
     合规建议：上市公司应立即启动内部核查程序，联系实控人家属或律师确认信息真实性，并委托律师协助起草披露公告。

4. 股票涉及家族信托或离岸架构的特殊处理
   若实控人通过家族信托、离岸公司等架构持有股票，需区分信托财产独立性原则与刑事追缴范围：

   • 合法设立的信托：若信托财产来源合法且无恶意逃避债务、洗钱等情形，司法机关一般不得直接处置信托财产（如《信托法》第17条）；
     
   • 违法所得设立的信托：若股票实际为贪污、受贿等违法所得，司法机关可依法撤销信托并追缴财产（如《刑法》第64条）。
     风险提示：离岸架构的合法性需结合境外法律审查，可能涉及国际司法协助程序，处理周期较长。

总结建议：实控人被留置后，其股票处理需结合股票性质、案件阶段、是否涉及信息披露及架构设计综合判断。建议家属或公司立即委托律师介入，一方面与办案机关沟通了解案件进展，另一方面评估股票处置风险，制定应对方案（如申请解除冻结、参与执行异议或合规披露）。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。