结论：公司只有2名股东时，股东在公司章程范围之外签订的股东合作协议，其有效性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：

一、协议内容合法性

1. 不违反法律法规：如果股东合作协议的内容不违反国家法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，那么该协议在内容上是合法的，具备生效的前提条件。
2. 不违背公序良俗：协议内容还需符合社会公德和公共秩序，不违背公序良俗，这是协议有效性的另一重要基础。

二、协议与公司章程的关系

1. 不冲突原则：股东合作协议与公司章程在内容上不应存在冲突。如果协议中的条款与公司章程中的规定相悖，那么该条款可能因违反公司章程而无效。但需要注意的是，公司章程的修改需遵循法定程序，未经修改的公司章程对股东具有约束力。
2. 补充与细化：股东合作协议可以在不违反公司章程的前提下，对公司章程中的某些条款进行补充或细化。例如，对于股东的权利义务、利润分配方式等，协议可以作出更具体的规定。

三、协议签订程序

1. 股东意思表示真实：股东在签订合作协议时，应确保意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。如果股东在签订协议时受到欺诈或胁迫，那么该协议可能因意思表示不真实而无效。
2. 协议形式合法：虽然股东合作协议并非必须采用书面形式，但为了确保协议的明确性和可证明性，建议采用书面形式签订。此外，如果协议涉及公司重大事项的变更，如股权转让、增资扩股等，还需遵循公司法等相关法律法规的规定，履行相应的程序。

四、实际履行情况

1. 协议实际履行：如果股东合作协议签订后，双方按照协议约定实际履行了各自的义务，且未出现违约情形，那么该协议在实际履行过程中是有效的。
2. 纠纷解决机制：协议中应明确约定纠纷解决机制，如协商、调解、仲裁或诉讼等。在出现纠纷时，双方应按照协议约定的方式解决纠纷，以维护协议的稳定性和有效性。

五、特殊情况考虑

1. 小股东权益保护：在公司只有两名股东的情况下，如果其中一名股东为小股东，那么在签订股东合作协议时，应特别注意保护小股东的权益。例如，可以约定小股东的优先购买权、知情权等，以防止大股东利用优势地位损害小股东的利益。
2. 协议变更与解除：随着公司经营状况的变化，股东合作协议可能需要变更或解除。在变更或解除协议时，双方应协商一致，并签订书面协议。如果无法协商一致，可以按照协议约定的纠纷解决机制处理。

建议：为了确保股东合作协议的有效性，建议股东在签订协议前咨询专业律师，对协议内容进行全面审查。同时，在协议签订后，双方应严格按照协议约定履行各自的义务，以维护协议的稳定性和有效性。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。