结论：证据不足免于起诉的情况下，单位是否会处分，取决于单位性质、内部规章制度以及具体案情，无法一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、单位性质与内部规章制度的影响

1. 国有企业或事业单位：

   • 这类单位通常有较为严格的内部规章制度，对于员工的违法违纪行为有明确的处分规定。
   • 如果员工被检察机关因证据不足免于起诉，但单位认为其行为违反了内部规章制度，可能会依据规章制度进行处分，如警告、记过、降级、撤职等。

2. 私营企业或外资企业：

   • 这类单位的内部规章制度可能相对灵活，对员工的处分也更多依赖于单位的管理需要和实际情况。
   • 如果员工被免于起诉，单位可能会根据其行为对单位造成的影响、员工的认错态度等因素，决定是否进行处分以及处分的轻重。

二、具体案情的影响

1. 行为性质：

   • 如果员工的行为虽然未被起诉，但性质恶劣，如涉及贪污、受贿、挪用公款等严重违法违纪行为，即使证据不足，单位也可能基于维护自身形象和内部管理的需要，进行严肃处理。
   • 如果员工的行为情节轻微，且未对单位造成实质性损害，单位可能选择不进行处分或仅进行轻微警告。

2. 证据情况：

   • 证据不足免于起诉，并不意味着员工的行为完全无辜。有时，由于证据收集困难或证据链不完整，导致检察机关无法提起公诉。
   • 单位在考虑是否处分时，可能会综合评估证据情况、员工行为的可能性以及单位的管理需要。

三、法律建议

1. 了解单位规章制度：

   • 员工应详细了解所在单位的内部规章制度，特别是关于违法违纪行为的处分规定。
   • 这样可以在面临类似情况时，更好地评估自己可能面临的法律后果。

2. 积极沟通与解释：

   • 如果员工被检察机关免于起诉，但担心单位会进行处分，可以主动与单位沟通，解释情况，提供相关证据或说明。
   • 通过积极沟通，可以增进单位对员工的理解，减少不必要的误会和处分。

3. 寻求法律援助：

   • 如果员工认为单位的处分决定不合理或违法，可以寻求法律援助，维护自己的合法权益。
   • 作为专业律师，我可以提供刑事辩护、婚姻家庭、经济纠纷、劳动纠纷、合同纠纷、拆迁安置等领域的法律咨询和帮助。

总结：证据不足免于起诉并不意味着单位一定不会处分员工。单位是否会处分取决于多种因素，包括单位性质、内部规章制度以及具体案情。因此，员工在面临类似情况时，应详细了解单位规章制度，积极沟通与解释，并在必要时寻求法律援助。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。