有权确认行政行为无效的机关主要包括人民法院以及作出行政行为的行政机关的上级机关或有权机关。以下是对此问题的详细分析：
一、人民法院的确认权
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》第七十五条及相关司法解释，人民法院在审理行政案件时，有权对行政行为的合法性进行审查。若发现行政行为存在重大且明显违法的情形，人民法院可以依法确认该行政行为无效。
实践应用：
- 在行政诉讼过程中，若原告（行政相对人）主张行政行为无效，并提供了相应的证据和理由，人民法院将依法进行审查。若审查认为行政行为确实存在无效情形，如主体无资格、超越权限、内容违法等，人民法院将作出确认无效的判决。
二、作出行政行为的行政机关的上级机关或有权机关的确认权
行政复议途径：
- 行政相对人若认为行政行为无效，可以依法向作出行政行为的行政机关的上级机关或有权机关申请行政复议。在行政复议过程中，复议机关将对行政行为的合法性进行全面审查。若发现行政行为存在无效情形，复议机关有权确认该行政行为无效，并可以撤销或变更该行政行为。
行政监督途径：
- 除了行政复议外，上级行政机关或有权机关还可以通过行政监督的方式对下级行政机关的行政行为进行审查。若发现下级行政机关作出的行政行为存在无效情形，上级行政机关或有权机关有权直接确认该行政行为无效，并要求下级行政机关予以纠正。
三、无效行政行为的常见情形
为了更好地理解哪些行政行为可能被确认无效，以下列举一些常见的无效行政行为情形：
主体无资格：
- 作出行政行为的主体不具备相应的行政职权或法律资格，如非法定授权的主体作出的行政行为。
超越权限：
- 行政主体超出法律、法规规定的职权范围，包括地域、级别、事务管辖范围的超越。
内容违法：
- 行政行为的内容直接违反法律的强制性规定或违背公序良俗，如允许在饮用水水源一级保护区内建设污染项目的行政许可。
程序严重违法：
- 行政行为的作出违反了法定程序，且无法通过后续补救措施纠正，如未告知陈述、申辩和听证权利即直接作出处罚决定。
受胁迫作出的行政行为：
- 行政主体在胁迫下作出的行政行为，因缺乏真实意思表示而无效。
四、法律后果与救济途径
法律后果：
- 无效行政行为自始无效，不产生法律效力。行政相对人可以随时主张其无效，并有权要求行政机关返还因无效行政行为而获得的利益，取消所加义务，并赔偿实际损失。
救济途径：
- 行政相对人若认为行政行为无效，可以通过行政复议或行政诉讼等途径寻求救济。在行政复议或行政诉讼过程中，行政相对人需要提供相应的证据和理由来支持其主张。
总结：有权确认行政行为无效的机关主要包括人民法院以及作出行政行为的行政机关的上级机关或有权机关。在实际应用中，应依据具体法律规定和案件事实，综合判断行政行为的合法性及有效性。若您遇到相关问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。