超过诉讼时效的案子，法院仍然会立案，但原告可能因被告提出诉讼时效抗辩而丧失胜诉权。以下是对这一问题的详细分析：
一、诉讼时效与起诉权、胜诉权的关系
诉讼时效是权利人请求法院保护其民事权利的法定期间。超过这一期间，权利人丧失的是胜诉权，即法院可能不再支持其诉讼请求，但并未丧失起诉权，仍有权向法院提起诉讼。这意味着，即使案件超过了诉讼时效，原告仍然可以向法院提起诉讼，法院也会依法受理。
二、法院的立案受理原则
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院在受理案件时，主要对起诉材料进行形式审查，包括原告是否与本案有直接利害关系、是否有明确的被告、是否有具体的诉讼请求和事实理由、是否属于法院受理范围等。只要符合这些立案条件，法院就会依法受理并立案，而不会主动审查案件是否超过诉讼时效。
三、诉讼时效抗辩的影响及法院的处理
被告未提出诉讼时效抗辩：在审理过程中，如果被告没有以诉讼时效已过为由进行抗辩，根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》，人民法院不会对诉讼时效问题进行释明及主动适用诉讼时效的规定进行裁判。这意味着，除非被告明确提出，否则法院不会主动审查诉讼时效问题，而是会按照正常的程序对案件进行审理并作出判决。
被告提出诉讼时效抗辩：如果被告在一审期间提出了诉讼时效抗辩，并且经法院审理查明，诉讼时效确实已经届满，且不存在诉讼时效中止、中断或延长等法定情形的，法院会判决驳回原告的诉讼请求。这是因为，虽然案件被受理，但原告因超过诉讼时效而丧失了胜诉权。
四、特殊情况下的处理
根据《中华人民共和国民法典》的规定，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。但在某些特殊情况下，如权利人因客观原因无法及时行使权利等，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间，为权利人提供法律救济的途径。
五、建议与总结
及时行使权利：为了避免不必要的法律风险，建议当事人尽量在诉讼时效期内提起诉讼。这样不仅能确保自己的合法权益得到有效保护，还能避免因为超过诉讼时效而带来的不利后果。
咨询专业律师：在面临诉讼时效问题时，由于法律条文复杂且可能存在特殊情况，建议当事人咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，超过诉讼时效的案子法院仍然会立案，但原告可能因被告提出诉讼时效抗辩而丧失胜诉权。因此，在权利受到侵害时，请务必及时行使权利，并在必要时咨询专业律师以获取法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。