如果公司以不能胜任工作为由开除员工，且打官司输了，员工通常有权获得赔偿，具体赔偿情况需根据实际情况判断，但一般包含经济补偿金（N）甚至赔偿金（2N）。以下是对此问题的详细分析：
一、公司以不能胜任工作为由开除员工的合法性及赔偿情况
合法解除劳动合同的情况：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，如果员工确实不能胜任工作，且经过培训或者调整工作岗位后仍不能胜任工作的，公司可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
- 在这种情况下，公司需要支付员工经济补偿金，即通常所说的“N”赔偿。经济补偿金的计算方式是：按照员工在公司工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
违法解除劳动合同的情况：
- 如果公司没有充分的证据证明员工不能胜任工作，或者未经过培训或调整工作岗位就直接解除劳动合同，那么公司的行为可能构成违法解除。
- 在这种情况下，员工有权要求公司支付赔偿金，即通常所说的“2N”赔偿。赔偿金是经济补偿金的两倍，计算方式与经济补偿金相同，但数额是经济补偿金的两倍。
二、打官司输了对赔偿的影响
- 如果员工认为公司违法解除劳动合同并提起诉讼，但最终法院判决员工败诉，这通常意味着法院认为公司的解除行为是合法的，或者员工未能提供充分的证据证明公司的解除行为违法。
- 在这种情况下，员工可能无法获得赔偿金（2N），但如果公司解除劳动合同的行为符合合法解除的条件（如员工确实不能胜任工作，且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任），员工仍然有权获得经济补偿金（N）。
- 然而，如果法院判决员工败诉是因为公司提供了充分的证据证明其解除行为的合法性，且员工确实存在不能胜任工作的情况，那么员工可能连经济补偿金（N）都无法获得的情况较为少见，除非合同或公司规章制度中有特别约定。但根据一般法律原则，即使员工不能胜任工作，公司在合法解除时也应支付经济补偿金。若因员工败诉而完全丧失赔偿，通常意味着法院认定公司解除行为完全合法且无需支付任何补偿的极端情形，这在实践中较为罕见。更常见的是，员工败诉可能仅影响赔偿金的获取，而不影响经济补偿金的支付（除非公司解除行为完全合法且无需补偿）。
三、特殊情况下的赔偿
- 如果员工在公司的工作年限较长，或者工资水平较高，那么经济补偿金或赔偿金的数额可能会相应增加。
- 另外，如果公司解除劳动合同的行为还涉及其他违法行为（如未提前通知、未支付工资等），员工还可以要求公司支付相应的赔偿或补偿。
四、建议
- 如果您面临类似的情况，建议首先与公司进行协商，尝试通过友好方式解决争议。
- 如果协商无果，您可以考虑向劳动仲裁机构申请仲裁，或者向法院提起诉讼。
- 在整个过程中，建议您保留好相关证据（如工作记录、培训记录、工资单等），以便在需要时证明自己的权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和帮助。