结论：总公司调入到子公司后被辞退，是否可以起诉母公司，这取决于具体的劳动关系归属以及辞退行为的实施主体。以下从不同角度进行分析：
一、劳动关系归属是关键
劳动关系在母公司：
- 如果员工虽然被调入子公司工作，但其劳动关系仍然保留在母公司，且辞退决定是由母公司作出的，那么员工可以直接起诉母公司，要求其承担违法辞退的法律责任。
- 在此情况下，子公司可能只是作为用工单位，实际使用员工，但并不承担劳动关系的法律责任。
劳动关系已转移至子公司：
- 如果员工在调入子公司后，其劳动关系已经正式转移至子公司，且辞退决定是由子公司作出的，那么员工应当起诉子公司，而非母公司。
- 此时，母公司不再是员工的用人单位，因此不承担辞退的法律责任。
二、辞退行为的实施主体
母公司直接辞退：
- 如果母公司直接向员工发出辞退通知，且员工劳动关系仍在母公司，那么员工可以起诉母公司。
- 即便员工在子公司工作，但只要劳动关系未转移，母公司仍需对其辞退行为负责。
子公司辞退，但受母公司指示：
- 如果子公司是在母公司的指示下辞退员工，且员工劳动关系已转移至子公司，那么员工通常应起诉子公司。
- 但在此情况下，如果母公司存在过错（如指示子公司违法辞退），员工在起诉子公司的同时，也可以尝试追究母公司的连带责任（这取决于具体案情和法律规定，并非绝对）。不过，从直接法律责任的角度来看，子公司是辞退行为的直接实施者，因此更可能成为被告。
三、法律建议
确认劳动关系归属：
- 员工应首先确认自己的劳动关系是保留在母公司还是已转移至子公司。这可以通过查看劳动合同、社保缴纳记录、工资发放记录等证据来确定。
收集证据：
- 无论起诉母公司还是子公司，员工都需要收集相关证据来证明辞退行为的违法性（如辞退通知、工作记录、沟通记录等）。
咨询专业律师：
- 由于劳动纠纷案件往往涉及复杂的法律关系和证据收集，因此建议员工在起诉前咨询专业律师，以便更准确地判断自己的权益和诉讼策略。
进一步思考：在实际操作中，员工被总公司调入子公司后被辞退的情况可能涉及多种法律关系和利益纠葛。因此，在处理此类案件时，需要综合考虑多种因素，包括劳动关系的归属、辞退行为的实施主体、相关证据的收集等。如果你面临类似情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。