在立案后发现违法行为主体认定错误的情况下，销案处理主要依据的是《中华人民共和国行政处罚法》以及相关程序性规定。以下是详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政机关在立案后，如果发现违法行为主体认定错误，即原本认定的违法行为人并非实际实施违法行为的人，那么行政机关应当依法撤销案件。这是因为行政处罚必须基于准确的事实认定，如果主体认定错误，那么整个处罚决定的基础就不存在，因此必须予以撤销。
   • 具体来说，虽然《行政处罚法》中并未直接提及“销案”这一术语，但根据该法第五十七条的规定，调查终结后，行政机关负责人应当对调查结果进行审查，根据不同情况分别作出决定。其中，如果“违法事实不能成立的，不得给予行政处罚”，这实际上就隐含了如果主体认定错误，即违法事实不成立的一种情形，因此应当撤销案件。

2. 程序性规定：

   • 在实际操作中，行政机关在发现主体认定错误后，通常会按照内部程序进行案件撤销。这可能包括填写撤销案件审批表、说明撤销理由、报经行政机关负责人批准等步骤。
   • 撤销案件后，行政机关还应当及时通知相关当事人，并告知其撤销案件的理由和依据。这是保障当事人知情权的重要体现。

3. 实践中的注意事项：

   • 行政机关在撤销案件时，应当确保撤销决定的合法性和合理性。如果撤销决定本身存在错误或不当，可能会引发新的行政争议或法律纠纷。
   • 对于已经作出的部分行政处罚决定（如罚款、没收违法所得等），如果因主体认定错误而撤销案件，那么这些已经作出的处罚决定也应当一并撤销或变更。
   • 行政机关在撤销案件后，如果发现新的违法行为人或新的违法事实，可以重新立案进行调查处理。

举例说明：假设某行政机关在立案调查一起环境污染案件时，原本认定某企业为违法行为人并进行了处罚。但在后续调查中，行政机关发现实际实施污染行为的是该企业的一名员工，而非企业本身。在这种情况下，行政机关就应当依据《行政处罚法》的相关规定撤销原案件，并重新立案调查该员工的违法行为。

建议：如果您在行政案件中遇到了主体认定错误的情况，建议您及时与行政机关沟通并说明情况，要求其依法撤销案件。如果行政机关拒绝撤销或处理不当，您可以考虑通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。