约定在某仲裁委员会分会仲裁，仲裁条款是否有效，需根据具体情况判断，但通常情况下，如果分会属于该仲裁委员会的合法分支机构且符合相关法律规定，该仲裁条款是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、有效情形
分会属于合法分支机构：
- 如果某仲裁委员会的分会是该仲裁委员会依法设立的分支机构，且具备处理仲裁案件的能力和资质，那么约定在该分会仲裁通常是被认可的。这种情况下，仲裁条款的有效性主要取决于分会是否具备合法的仲裁主体资格。
符合仲裁协议的形式要件：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，有效的仲裁协议应包含请求仲裁的意思表示、仲裁事项以及选定的仲裁委员会。如果仲裁条款中明确约定了将争议提交某仲裁委员会的分会仲裁，且该分会能够明确识别，同时仲裁事项属于法律规定的可仲裁范围，那么该仲裁条款通常有效。
不违反法律强制性规定：
- 仲裁条款的约定不得违反法律的强制性规定。例如，不得约定将婚姻、收养、监护、扶养、继承纠纷等不能仲裁的事项提交仲裁。只要仲裁条款不涉及这些不能仲裁的事项，且符合其他法律规定，其有效性通常不会受到影响。
二、无效情形
分会不具备合法资格：
- 如果某仲裁委员会的分会并非依法设立，或者不具备处理仲裁案件的能力和资质，那么约定在该分会仲裁的仲裁条款可能因仲裁机构不明确或不具备合法资格而无效。
仲裁协议形式要件缺失：
- 如果仲裁条款缺少请求仲裁的意思表示、仲裁事项或选定的仲裁委员会（包括分会）中的任何一个要素，该协议将被认定为无效。例如，仅约定“在某地仲裁”而未明确具体仲裁机构或分会，可能导致仲裁条款无效。
违反法律强制性规定：
- 如前所述，如果仲裁条款约定将不能仲裁的事项提交仲裁，或者违反其他法律的强制性规定，该仲裁条款同样无效。
三、特殊情况下的考虑
- 分会名称的确定性：即使仲裁条款中约定的分会名称不完全准确，但只要能够确定具体的分会，就应认定选定了仲裁机构。例如，如果约定由“某仲裁委员会在某地的分会”仲裁，且该地确实存在该仲裁委员会的唯一分会，那么该约定通常有效。
- 当事人意思表示的真实性：仲裁条款必须是双方当事人真实意思的表示。如果存在欺诈、胁迫等情形导致一方当事人违背真实意愿签订仲裁条款，则该条款可能被视为无效。
四、建议
- 明确约定仲裁机构：在签订仲裁协议时，建议双方明确约定具体的仲裁委员会及其分会（如果适用），以避免因仲裁机构不明确而产生的争议。
- 咨询专业律师：如果对仲裁条款的有效性存在疑问或不确定之处，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。