在车辆挂靠关系中，谁作为原告取决于具体的纠纷类型和案件事实，不能一概而论是挂靠公司还是实际车主。以下从不同纠纷类型和角度进行分析：
一、合同纠纷
如果纠纷涉及挂靠协议本身：
- 实际车主作为原告：若实际车主认为挂靠公司违反了挂靠协议中的约定，如未提供约定的服务、未支付应得的费用等，实际车主可以依据挂靠协议，以挂靠公司为被告提起诉讼，要求其履行合同义务或赔偿损失。
- 挂靠公司作为原告：反之，如果挂靠公司认为实际车主违反了挂靠协议，如未按时缴纳管理费、未遵守公司规定等，挂靠公司也可以以实际车主为被告提起诉讼，要求其承担违约责任。
如果纠纷涉及第三方与挂靠公司或实际车主之间的合同：
- 根据合同相对性原则：合同纠纷通常应由合同双方当事人作为原告和被告。例如，如果第三方与挂靠公司签订了运输合同，但实际履行的是实际车主，那么因合同履行产生的纠纷，应由第三方与挂靠公司作为诉讼双方。然而，如果实际车主在履行合同过程中造成了第三方损失，且该损失与挂靠公司有关（如挂靠公司未尽到管理责任），那么第三方也可能选择将挂靠公司和实际车主作为共同被告。
二、侵权纠纷
交通事故责任纠纷：
- 实际车主作为原告：如果实际车主的车辆在挂靠期间发生交通事故，且实际车主认为挂靠公司对事故的发生有过错（如未提供安全培训、未对车辆进行定期检查等），实际车主可以以挂靠公司为被告提起诉讼，要求其承担相应的赔偿责任。
- 第三方作为原告：如果交通事故造成了第三方损失，第三方可以根据事故责任认定书，选择以实际车主、挂靠公司或两者为共同被告提起诉讼。在这种情况下，实际车主和挂靠公司可能因共同侵权或连带责任而成为共同被告。
其他侵权纠纷：
- 如果挂靠公司或实际车主的行为侵犯了第三方的合法权益（如名誉权、隐私权等），第三方可以以侵权方（挂靠公司或实际车主）为被告提起诉讼。
三、特殊情况下的原告确定
- 挂靠公司破产或注销：如果挂靠公司因破产或注销等原因不再存在，但实际车主与挂靠公司之间的纠纷尚未解决，实际车主可能需要根据具体情况，以挂靠公司的清算组、股东或相关责任人为被告提起诉讼。
- 实际车主失踪或死亡：如果实际车主失踪或死亡，其继承人或利害关系人可能需要根据相关法律规定，以挂靠公司为被告提起诉讼，要求其承担相应的法律责任。
法律建议：
- 在车辆挂靠关系中，挂靠公司和实际车主应明确各自的权利和义务，签订详细的挂靠协议，并在协议中约定纠纷解决方式（如仲裁或诉讼）。
- 一旦发生纠纷，双方应首先尝试通过协商或调解等方式解决。如果协商或调解无果，再考虑通过法律途径解决。
- 在提起诉讼前，双方应充分收集证据，包括挂靠协议、合同履行记录、交通事故责任认定书等，以便在诉讼中证明自己的主张。
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