三方合同发生纠纷时，可以通过仲裁的方式解决，但前提是三方合同中存在有效的仲裁条款，或者三方在纠纷发生后达成了仲裁协议。以下从不同角度为你详细分析：

一、仲裁条款或协议的有效性

1. 仲裁条款的约定：三方合同中应明确约定仲裁条款，包括仲裁机构的选择、仲裁规则、仲裁地点等。这是仲裁程序启动的基础，没有有效的仲裁条款，仲裁机构将无权受理。
2. 仲裁协议的达成：如果合同中没有仲裁条款，但三方在纠纷发生后达成了仲裁协议，同样可以提交仲裁解决。仲裁协议应当是书面形式，并明确仲裁事项和选定的仲裁委员会。

二、仲裁程序的启动

1. 提交仲裁申请：一方或多方根据仲裁条款或协议，向选定的仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
2. 仲裁委员会受理：仲裁委员会在收到仲裁申请后，会进行审查，确认是否符合受理条件。如果符合，将发出受理通知，并通知其他当事人。
3. 仲裁庭的组成：仲裁委员会会根据仲裁规则，组成仲裁庭，负责审理案件。仲裁庭通常由一名或三名仲裁员组成，具体人数根据仲裁规则和案件情况确定。
4. 开庭审理：仲裁庭会安排开庭审理，双方当事人有机会陈述意见、提交证据、进行辩论等。仲裁庭会根据双方当事人的陈述和证据，进行裁决。

三、仲裁裁决的执行

1. 裁决的作出：仲裁庭在审理结束后，会作出裁决。裁决是终局的，对双方当事人具有约束力。
2. 裁决的执行：如果一方当事人不履行裁决，另一方当事人可以向有管辖权的人民法院申请强制执行。法院会根据相关法律规定，对裁决进行审查，并决定是否执行。

四、特殊情况下的处理

1. 仲裁条款或协议无效：如果仲裁条款或协议存在无效情形，如违反法律强制性规定、欺诈、胁迫等，当事人可以向人民法院提起诉讼，解决纠纷。
2. 仲裁机构无管辖权：如果仲裁机构认为案件不属于其管辖范围，会拒绝受理或终止仲裁程序。此时，当事人可以根据合同约定或法律规定，选择其他争议解决方式。

建议：在签订三方合同时，务必明确约定仲裁条款或协议，以便在发生纠纷时能够迅速、有效地解决。同时，在仲裁过程中，要积极配合仲裁庭的工作，提供必要的证据和材料，以维护自己的合法权益。如果你有三方合同仲裁方面的具体问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。