甲方按照超过合同约定的比例支付第一笔款项，这一行为本身并不直接构成法律问题，但可能引发一系列后续的法律和实务问题，具体分析如下：

1. 合同履行与变更：

   • 合同履行：合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。甲方按照合同约定的比例支付款项是履行合同义务的表现。若甲方支付超过约定比例，从合同履行的角度看，这并不违反合同约定，但也不是合同明确要求的。
   • 合同变更：若甲方支付超过约定比例的款项，且双方对此有明确的书面或口头协议（如补充协议、变更协议等），则这可以视为对原合同的变更。但若无此类协议，甲方单方面支付超额款项，并不直接导致合同条款的变更。

2. 法律后果与风险：

   • 甲方风险：甲方支付超过约定比例的款项，可能面临资金占用、利息损失等风险。若后续双方因合同履行产生争议，甲方可能难以主张返还超额支付的部分，除非能证明该支付行为存在错误或双方有明确约定。
   • 乙方风险：乙方接收超过约定比例的款项，虽然短期内获得了资金利益，但也可能面临法律风险。如甲方后续主张返还，乙方可能需承担返还义务，并可能因不当得利而承担法律责任。此外，若乙方因此产生了额外的成本或费用，也可能难以向甲方主张补偿。

3. 实务建议：

   • 明确约定：双方在签订合同时，应明确约定付款比例、付款时间等关键条款，以避免后续争议。若甲方有意支付超过约定比例的款项，建议双方签订补充协议或变更协议，明确双方的权利义务。
   • 保留证据：无论甲方是否支付超额款项，双方都应保留好相关证据，如付款凭证、合同文本、补充协议等，以备不时之需。
   • 及时沟通：若甲方支付了超额款项，双方应及时沟通，明确该款项的性质和用途，以避免后续误解和争议。

总结来说，甲方按照超过合同约定的比例支付第一笔款项，虽然不直接构成法律问题，但可能引发一系列后续的法律和实务问题。因此，建议双方在签订合同时明确约定关键条款，并在支付超额款项时签订补充协议或变更协议，以明确双方的权利义务。若您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。