政府在符合法定条件和程序的前提下，可以将国有土地协议出让给地方国有企业，但需严格遵循《招标拍卖挂牌出让国有建设用地使用权规定》等法律法规的例外情形。具体分析如下：

1. 协议出让的法定限制
   根据《招标拍卖挂牌出让国有建设用地使用权规定》（国土资源部令第39号）第四条，工业、商业、旅游、娱乐和商品住宅等经营性用地，以及同一宗地有两个以上意向用地者的，必须以招标、拍卖或挂牌方式公开出让。这意味着，若地方国有企业申请的土地属于上述经营性用途，或存在其他竞争主体，政府不得直接协议出让。

2. 协议出让的例外情形
   若土地用途符合《协议出让国有土地使用权规定》（国土资源部令第21号）第三条的情形，可依法协议出让，包括：

   • 供应特定用途土地：如国家重点扶持的能源、交通、水利等基础设施项目用地；
     
   • 原土地使用者申请续期：以划拨方式取得土地使用权后，需继续使用原土地且符合规划的；
     
   • 调整土地用途：出让土地使用权人申请续期时，政府依法批准调整为非经营性用途的；
     
   • 其他特殊情形：如政府为实施城市规划进行旧城区改造需协议出让的。
     地方国有企业若符合上述例外情形，政府可依法协议出让土地。

3. 程序合规性要求
   即使符合协议出让条件，政府仍需履行法定程序：

   • 公示与审批：需在土地有形市场或指定场所、媒介发布出让计划，公示期不少于15日；
     
   • 地价评估：通过专业机构评估土地市场价格，协议出让价格不得低于基准地价和标定地价；
     
   • 集体决策：出让方案需经政府集体决策，避免暗箱操作。
     若程序违法（如未公示、低价出让），可能面临行政复议或诉讼风险。

4. 地方国有企业的特殊性
   地方国有企业虽属国有主体，但不因身份豁免法定程序。若其申请土地用于经营性用途（如开发商业地产），仍需通过招拍挂程序竞得土地使用权。实践中，部分地方政府可能通过“定向挂牌”等方式变相协议出让，但此类操作存在合规风险，可能被认定为规避招拍挂程序。

建议：若地方国有企业需通过协议方式取得土地，应严格审查土地用途是否符合例外情形，并确保程序合规。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范。