合同效力及赔偿款转移问题需分情况讨论，核心结论如下：

1. 合同效力问题
   根据《民法典》第215条，未办理物权登记（过户）不影响买卖合同效力，合同自成立时生效。因此，您与卖方签订的房屋买卖合同本身有效，双方需按合同约定履行义务。但需注意：
   

• 若房屋属于宅基地使用权及地上房屋，根据《土地管理法》第62条，宅基地使用权仅限本集体经济组织成员内部流转。若您非本村村民，合同可能因违反法律强制性规定而无效，此时赔偿条款亦无效。
  
• 若您与卖方同属本村村民，合同有效，赔偿条款原则上有效。

1. 赔偿款转移条款的效力
   合同中若明确约定“卖方若将房屋另行处置（如转移给第三方），需向买方支付90万元赔偿款”，该条款属于违约责任约定，需满足以下条件方有效：
   

• 合理性：赔偿金额需与实际损失相当（如房屋市场价值、买方已支付款项等）。若90万元明显高于实际损失（如房屋价值仅50万元），卖方可依据《民法典》第585条请求法院调整赔偿金额。
  
• 可执行性：若卖方无足够财产履行赔偿义务，即使条款有效，您也可能面临执行困难。建议要求卖方提供担保（如抵押、保证人）或分期支付条款。
  
• 无其他无效情形：如合同未被撤销、未违反公序良俗等。

1. 卖方转移房屋给第三方的法律后果
   若卖方未经您同意将房屋过户给第三方，您可依据有效合同主张：
   

• 要求卖方继续履行合同（如办理过户），但若房屋已登记至第三方名下且第三方符合善意取得条件（如不知情、支付合理对价），您可能无法主张物权，只能要求赔偿。
  
• 要求卖方按合同约定支付赔偿款，但需以合同有效且赔偿条款合理为前提。
  

建议行动：

1. 立即核查房屋产权状态（如是否已过户至第三方）及第三方是否知情；
   
2. 收集合同、付款凭证等证据，评估合同效力及赔偿条款合理性；
   
3. 若卖方拒不履行，可向法院起诉要求赔偿或确认合同效力，必要时申请财产保全。
   

如有进一步细节需分析，可直接向我咨询。