对于民事案件中涉及刑事犯罪且已过追诉期的情况，我们首先要明确的是，这里的“追诉期”主要指的是刑事追诉时效。在刑事法律框架下，一旦案件过了追诉期，司法机关原则上将不再追究犯罪嫌疑人的刑事责任。不过，具体处理还需依据案件所处的不同阶段来详细分析，同时，民事权利的行使并不受刑事追诉时效的影响。

一、刑事案件不同阶段的处理

1. 侦查阶段：

   • 若公安机关在侦查过程中发现犯罪行为已超过法定的追诉时效期限，应当立即撤销案件，停止进一步的侦查活动。

2. 审查起诉阶段：

   • 当案件移送至检察机关进行审查起诉时，若检察机关发现犯罪已过追诉时效期限，应当依法作出不起诉决定，终止刑事诉讼程序。

3. 审判阶段：

   • 在法院审判过程中，若发现案件已过追诉时效期限，法院应当裁定终止审理。无论是公诉案件还是自诉案件，一旦查明追诉时效已过，法院都应立即停止审理，并作出相应的裁定。对于已经追究的，应当撤销案件、不起诉或者对终止审理的案件宣告无罪。

二、特殊情况的处理

值得注意的是，存在一些不受追诉期限限制的特殊情况。如：

• 人民检察院、公安机关、国家安全机关已立案侦查或在人民法院受理案件后，犯罪嫌疑人逃避侦查或审判的。
• 被害人在追诉期限内提出控告，但相关机关应当立案而不予立案的。

在这些特殊情况下，即使犯罪已过追诉期，司法机关仍可依法对犯罪嫌疑人进行追诉。

三、民事权利的行使

虽然刑事案件因追诉时效过期而不再追究刑事责任，但被害人因犯罪行为所遭受的损害并未因此消失。被害人有权在法律规定的诉讼时效内（注意这里是民事诉讼时效，与刑事追诉时效不同）向法院提起民事诉讼，要求犯罪嫌疑人或相关责任人进行赔偿。这一规定确保了被害人的合法权益得到保障。

四、结论与建议

综上所述，对于已过刑事追诉期的案件，司法机关将根据案件所处的不同阶段进行相应的法律处理。同时，被害人仍有权通过民事诉讼途径寻求损害赔偿。每个具体案件的情况都有所不同，因此在处理时需结合实际情况和相关法律法规进行具体分析。如果您面临此类问题，建议咨询专业的法律人士以获取更具体的建议和帮助。他们可以根据您的具体情况，提供更为精准和个性化的法律指导。