一般情况下，不会因相同案件被两个不同部门基于同一违法行为重复罚款，但存在例外情形需具体分析。以下从不同角度详细说明：
- “一事不再罚”原则的适用
根据《行政处罚法》第二十九条，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。例如，企业因未按规定排放污染物被生态环境部门罚款后，若该行为未涉及其他违法要素（如同时违反安全生产规定），则市场监管部门不得以同一事实再次罚款。但需注意：
- “同一个违法行为”的认定：需满足行为主体、行为内容、损害结果等要素同一。若企业排放超标且未安装监测设备，可能被生态环境部门罚款（超标排放）和市场监管部门罚款（未履行监测义务），因涉及不同违法要素，不构成重复处罚。
- “罚款”的限定性：该原则仅禁止重复罚款，不禁止其他处罚类型。如企业因虚假宣传被市场监管部门罚款后，若同时构成不正当竞争，工商部门可责令停业整顿，但不得再次罚款。
- 例外情形：不同部门基于不同法律关系处罚
若同一案件涉及多个独立违法行为，或不同部门依据不同法律对同一行为的不同方面处罚，则可能被多次处罚。例如：
- 竞合型违法：司机酒驾（违反《道路交通安全法》）后肇事逃逸（违反《刑法》），可能同时面临交警部门的吊销驾照、罚款（行政处罚）和公安机关的刑事拘留、罚金（刑事处罚），因法律关系不同，不构成重复。
- 关联型违法：企业生产销售不合格产品（违反《产品质量法》）且未如实记录生产记录（违反《安全生产法》），市场监管部门可对产品质量问题罚款，应急管理部门可对安全生产问题罚款，因违法要素独立，不违反“一事不再罚”。
- 实务建议
- 核查处罚依据：若收到多个部门处罚通知，需核对处罚决定书中认定的违法事实、法律依据是否完全重合。若存在差异，可能涉及不同违法要素；若完全一致，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
- 主动沟通协调：若认为处罚存在重复，可向作出处罚的部门提出书面异议，或通过政府法制机构协调，避免程序空转。
- 保留证据材料：包括处罚决定书、现场检查记录、检测报告等，以便在复议或诉讼中证明违法行为同一性。
若您遇到具体案件被多部门处罚的情况，可直接向我咨询，我会结合处罚决定书内容、违法事实细节等，为您分析是否构成重复处罚及维权路径。