结论：无效合同中的结算与清理条款一般有效，约定合同无效的赔偿条款在符合法律规定时有效，而违约金条款在合同无效的情况下通常无效。

详细分析：

1. 结算与清理条款的有效性：

   • 法律依据：根据《民法典》的相关规定，合同无效、被撤销或者终止的，不影响合同中独立存在的有关解决争议方法的条款的效力。结算与清理条款通常被视为合同中独立存在的部分，它们不依赖于合同的整体效力，而是用于处理合同终止或无效后的财务和事务清理问题。
   • 实际应用：在合同无效的情况下，双方仍然需要按照结算与清理条款的约定，对已经发生的交易或行为进行结算，并清理相关事务。这有助于维护交易的公平性和秩序，减少因合同无效而产生的纠纷。

2. 约定合同无效的赔偿条款的有效性：

   • 法律依据：虽然合同整体无效，但双方可以在合同中约定，在合同无效时，一方应向另一方支付一定的赔偿。这种约定并不违反法律的强制性规定，因此是有效的。
   • 实际应用：在签订合同时，双方可以预见合同可能因各种原因而无效，为了保障自己的利益，可以在合同中约定赔偿条款。一旦合同无效，受损方可以依据这些条款要求对方进行赔偿。但需要注意的是，赔偿的范围和金额应当合理，不得过分高于或低于实际损失。

3. 违约金条款在无效合同中的效力：

   • 法律依据：违约金条款是合同中的一种重要条款，用于约束双方履行合同义务。然而，在合同无效的情况下，违约金条款也通常随之无效。因为违约金条款的有效性依赖于合同的整体效力，如果合同无效，那么违约金条款也失去了其存在的基础。
   • 实际应用：在合同无效的情况下，如果一方违反了合同中的其他义务（如未按照结算与清理条款进行结算），受损方不能依据违约金条款要求对方支付违约金。但受损方仍然可以依据法律规定，要求对方承担因违约行为而造成的实际损失。

建议与风险提示：

• 在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、有效。特别是对于结算与清理条款、赔偿条款和违约金条款等关键条款，应明确约定并理解其法律后果。
• 如果合同被认定为无效，双方应积极协商处理后续事宜，包括结算、清理和赔偿等问题。如果协商不成，可以寻求法律途径解决纠纷。
• 在处理无效合同纠纷时，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。

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