当民事案件的被告正在监狱服刑时，诉讼程序依然可以正常且有序地进行。以下是对此情况的详细解答与操作指南：
一、起诉准备与管辖法院确定
起诉材料准备：
- 起诉状：需详细列明原告与被告的基本信息（包括姓名、性别、年龄、住址等，若被告在监狱，需注明服刑地点及现状）、诉讼请求、事实与理由。
- 证据材料：收集与案件直接相关的证据，如合同、协议、借条、转账记录、聊天记录等，确保证据真实、合法且与案件事实紧密相关。
- 身份证明：提供原告的身份证明文件，如身份证复印件。
管辖法院确定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，对被监禁的人提起的诉讼，由原告住所地人民法院管辖；若原告住所地与经常居住地不一致，则由原告经常居住地人民法院管辖。这一规定旨在方便原告进行诉讼活动，减少其可能面临的不便。
二、诉讼文书送达与庭审安排
诉讼文书送达：
- 直接送达：法院会通过监狱的管理部门，将诉讼文书直接送达给在监狱服刑的被告人，确保其及时收到并了解诉讼相关事宜。
- 委托送达：若直接送达存在困难，法院可委托监狱所在地的基层法院或监狱管理机关代为送达。
庭审安排：
- 监狱内庭审：案件需要开庭审理时，法院会安排到监狱等羁押场所内进行庭审，以体现审判工作的便民性。
- 远程视频庭审：考虑到监狱的安全和管理规定，以及被告人的实际情况，法院也可通过远程视频等技术手段，让被告人参与庭审。
三、被告人出庭与代理
被告人申请到庭：
- 若案件情况允许，被告人可向法院申请到庭参加诉讼，法院会审查并安排。
委托代理人：
- 被告人可委托律师或其他符合法律规定的代理人参加诉讼，代理人需在授权范围内行使代理权，确保被告人的合法权益得到充分保障。
四、判决与执行
判决结果传达：
- 法院会依法对案件进行审理和判决，并通过合适方式将判决结果传达给被告，确保其知晓判决内容。
上诉与执行：
- 上诉权利：若被告对判决结果不服，可在规定期限内提起上诉，遵循法定步骤和要求。
- 执行措施：若被告未履行判决，原告可向法院申请强制执行。法院有权采取扣押、冻结、划拨、变价等多种执行措施，以实现原告的合法权益。若经查明确无财产可供执行，法院可依法中止执行，待中止情形消失后恢复执行。
五、注意事项与特殊挑战
实际操作中的困难：
- 由于监狱内的特殊环境，通信和交通的限制可能使诉讼过程变得复杂和耗时。因此，需提前规划并预留足够的时间，确保诉讼程序顺利进行。
辩护权利保障：
- 在押服刑人员的辩护权利可能受到一定程度限制，需采取必要措施确保其权利得到充分保障。例如，通过委托律师或提供法律援助等方式，确保被告人在诉讼过程中能够充分表达自己的意见和诉求。
综上所述，当民事案件的被告正在监狱服刑时，诉讼程序能够正常推进。通过明确的管辖法院确定、有效的诉讼文书送达、灵活的庭审安排与出庭方式、公正的判决与执行以及注意事项的充分考虑，能够有效地保障当事人的合法权益，体现法律的公正与公平。