关于事业单位在职人员能否自己开公司的问题，这确实是一个需要综合考虑多方面因素的情况，并非一概而论。以下是我为您详细梳理的分析和建议：
一、法律基础与一般原则
首先，从法律层面来看，《中华人民共和国公司法》并未直接禁止事业单位工作人员开办公司。但是，事业单位工作人员通常不允许从事与本单位业务相冲突的营利性活动，这是为了避免利益冲突、影响本职工作以及损害公共利益或单位利益。
二、具体条件与限制
参照公务员管理的事业编人员：
- 这类人员一般不可开办公司。因为相关党政规定明确禁止党政机关及其隶属的事业单位经商、办企业。
- 他们的干部、职工（包括退居二线的干部）除特殊批准外，不得在各类企业中担任职务。
非参照公务员管理的事业编人员：
- 如果所在单位没有明文禁止，且开办公司不妨碍本职工作、不占用单位资源和工作时间、不损及单位利益，并遵循相关法律法规，那么这类人员是可以依法开办企业的。
- 但需要注意的是，离职后的特定时间内（如领导职位三年内、其他公务员职位两年内），原公务员身份的事业单位工作人员不得注册公司。同时，正在被执行刑罚的事业单位工作人员同样不得注册公司。
经批准的情况：
- 部分科研类事业单位鼓励员工基于单位科研成果转化等进行创业。经过规范的审批流程，这类员工可以开展相关经营活动。
- 如果所在单位和上级主管部门批准同意，且经营活动不涉及与单位业务冲突等违规情形，那么也可以开办公司。
三、实践案例与风险警示
在实践中，确实存在事业单位人员因违规经商办企业而受到处罚的案例。这些人员往往利用职务便利违规承揽工程、注册成立公司并从中获利，最终受到了开除党籍、开除公职等严厉处分。因此，在决定开办公司前，一定要谨慎考虑并避免违规行为。
四、操作建议与注意事项
- 事先了解政策：在决定开办公司前，应详细了解所在单位及当地的具体政策、规定，确保自己的行为符合相关要求。
- 履行审批程序：如果需要开办公司，应按要求履行相关审批或报备程序，确保合规性。这不仅可以避免后续的法律风险，也有助于维护个人和单位的声誉。
- 咨询专业意见：如有任何疑问或不确定之处，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。他们可以根据您的具体情况提供针对性的建议和帮助。
- 遵守法律法规：在开办公司过程中，应严格遵守相关法律法规和单位规定，确保经营活动的合法性和合规性。这是维护个人权益和单位利益的基础。
综上所述，事业单位在职人员能否办公司需根据具体情况而定。在遵守相关法律法规和单位规定的前提下，部分事业单位在职人员是有可能开办公司的。但请务必谨慎操作并避免违规行为，以确保自己的合法权益和单位的利益不受损害。