结论：发工资没有扣个人所得税是否合法不能一概而论，需分情况讨论。

1. 符合免税条件的情况 根据《个人所得税法》第四条，特定类型的收入可免征个人所得税，例如：

• 省级人民政府、国务院部委颁发的科学、教育、技术等方面的奖金；
• 国债和国家发行的金融债券利息；
• 按照国家统一规定发放的补贴、津贴（如差旅费津贴、误餐补助）；
• 福利费、抚恤金、救济金等。 若工资收入完全属于上述免税范围，且用人单位已依法履行免税申报手续，则不扣税是合法的。

1. 未达起征点的情况 根据现行税法，居民个人综合所得（工资、薪金）的起征点为每月5000元（年度6万元）。若员工月工资未超过5000元，且无其他应税收入（如劳务报酬、稿酬等），则无需缴纳个人所得税。此时用人单位未扣税属于合法操作。

2. 应扣未扣的违法情形 若员工工资超过起征点，或存在其他应税收入（如年终奖、兼职收入等），但用人单位未依法代扣代缴个人所得税，则构成违法行为。根据《税收征收管理法》第六十九条，税务机关可对用人单位处以应扣未扣税款50%至3倍的罚款。

建议：

• 员工可通过个人所得税APP查询纳税记录，确认是否依法纳税；
• 用人单位应定期自查税务合规性，避免因漏税引发行政处罚；
• 若发现用人单位存在偷逃税行为，可向当地税务机关举报。

如有具体案例或进一步疑问，可直接向我咨询。