关于违章建筑如何认定实际损失的问题，这实际上涉及两个层面：一是违章建筑的认定，二是实际损失的评估与确定。以下我将结合相关法律法规和实际操作，为您详细解答。

一、违章建筑的认定

违章建筑的认定是一个综合法律程序与实体标准的过程，它主要依据以下几个方面：

1. 违反城乡规划法规：

   • 未取得建设工程规划许可证或未按照许可证规定进行建设的建筑，构成违章建筑。
   • 临时建筑超期未拆除的，同样视为违章建筑。

2. 违反土地管理法规：

   • 未经批准擅自占用土地，特别是农用地转为建设用地进行建设的，属于违章建筑。
   • 非法占用耕地进行非农业建设的，所建建筑为违章建筑。

3. 其他违法行为：

   • 擅自改变建筑物使用性质，如工业厂房改住宅等。
   • 侵占公共设施用地，如在已规划的公共用地上建设等。

认定程序通常包括立案调查、现场勘查、告知与申辩、作出认定决定等步骤。相关部门在发现或接到举报后，会进行立案调查，收集证据，实地记录建筑的位置、面积、结构等信息，并向当事人发出通知，告知涉嫌违章的事实、理由及依据，给予陈述、申辩的机会。最后，根据调查结果和当事人的陈述申辩，依法作出是否属于违章建筑的认定决定。

二、实际损失的评估与确定

对于违章建筑被认定后的实际损失，这通常涉及多个方面，包括但不限于：

1. 建筑成本损失：

   • 包括建筑材料、人工费用、设计费用等直接投入的成本。
   • 若建筑已被部分或全部拆除，还需考虑拆除费用及残值回收等。

2. 经营损失：

   • 若违章建筑用于商业经营，如店铺、仓库等，因拆除或停业导致的经营损失。
   • 包括预期收益、客户流失、合同违约等间接损失。

3. 其他相关损失：

   • 如因违章建筑被认定而导致的声誉损失、法律费用等。

评估方法：

• 专业评估机构评估：可以委托具有资质的评估机构对实际损失进行评估，出具评估报告。
• 自行估算与协商：在双方协商一致的情况下，也可以根据实际情况自行估算损失，并达成赔偿协议。

三、注意事项

1. 保留证据：在违章建筑被认定及处理过程中，应保留好相关证据，如建筑图纸、购买材料发票、经营记录等，以便后续评估损失和维权。
2. 法律救济：若对认定结果或损失评估有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
3. 合规建设：未来在进行建设活动时，应严格遵守相关法律法规，取得必要的许可和批准，避免再次出现违章建筑问题。

综上所述，违章建筑的认定是一个严格且复杂的法律过程，而实际损失的评估与确定则需要综合考虑多个方面。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。