员工主动辞职时，公司一般情况下不能随意扣工资，但在特定情况下可以依法扣除部分工资。以下是对此问题的详细分析：
一般情况
根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》，员工主动辞职并按照公司规定的流程提前通知公司（正式员工提前30日通知，试用期内员工提前3日通知），且在离职前履行了工作职责，单位无权无故克扣员工工资。员工提供了正常劳动，有权获得应得的劳动报酬。
特殊情况
在以下特殊情况下，公司可以依法扣除员工的部分工资：
经济损失赔偿：
- 如果员工未按规定程序辞职或未完成工作交接等，给公司造成直接经济损失，公司有权要求员工赔偿。
- 扣除的工资部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，若员工月工资为5000元，因突然离职造成2000元损失，公司最多可扣除1000元（计算公式：\(5000\times20\%=1000\)元）。
违反服务期或竞业限制约定：
- 如果员工入职时与公司签订了服务期条款或竞业限制条款，并在服务期未满或竞业限制期内主动辞职，可能需要按约定支付违约金。
- 这种扣款是基于双方事先的约定，并非无故扣工资。
公司合法规章制度明确扣钱情形：
- 公司的规章制度如果经过民主程序制定，内容不违反法律法规的强制性规定，并已向员工公示或告知，其中明确规定了在员工主动辞职时某些情形下可以扣钱，且该扣钱规定合理合法。
- 那么在员工出现相应情形时，公司可以依据规章制度扣钱，例如未办理工作交接手续需扣除一定金额等。
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 《工资支付暂行规定》明确了用人单位不得克扣劳动者工资的情形，但也列出了可以代扣的情况，如个人所得税、社会保险费用等。同时，也规定了因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
维权途径
如果员工认为自己的工资被公司无故扣除，可以通过以下途径维护合法权益：
- 与公司协商：首先尝试与公司沟通协商，寻求解决方案。
- 申请劳动仲裁：若协商无果，可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 提起诉讼：对劳动仲裁结果不服时，可依法向人民法院提起诉讼。
综上所述，员工主动辞职时，公司是否能扣钱需根据具体情况判断。员工应了解自己的权益和义务，并在必要时通过合法途径维护自己的权益。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。