在约定了有效的仲裁委员会进行仲裁的情况下，当事人一般应通过仲裁解决争议，而不能直接向法院起诉。但在特定情况下，当事人可以向法院提起诉讼。以下是对这一问题的详细分析：

一、仲裁条款的效力与选择

双方当事人如果在合同中明确约定了仲裁条款，或者事后达成了书面仲裁协议，并且该仲裁事项属于法律规定的可仲裁范围，那么当发生争议时，应当按照约定申请仲裁，而不是向法院提起诉讼。这是因为仲裁和诉讼是并列的两种解决争议的方式，它们各自有独立的程序和规则。一旦选择了仲裁，就意味着接受了仲裁的规则和程序，以及仲裁裁决的结果。例如，若合同中明确约定“因本合同产生的争议提交XX仲裁委员会仲裁”，则双方需优先通过仲裁程序解决纠纷。

二、仲裁条款排除法院司法管辖权

仲裁协议具有排除法院司法管辖权的法律效力。这意味着，如果当事人之间已经存在有效的仲裁条款，那么当出现约定范围内的争议时，应当通过仲裁途径解决，而不能再向法院起诉。这是仲裁制度的基本原则之一，也是保障仲裁独立性和权威性的重要体现。

三、特殊情况下的法院诉讼

尽管仲裁条款具有排除法院司法管辖权的效力，但在以下特殊情况下，当事人仍然可以向法院提起诉讼：

1. 仲裁条款无效：

   • 如果仲裁条款本身存在法定无效的情形，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等，那么该仲裁条款自始无效，当事人可以向法院起诉。
   • 示例：若合同中的仲裁条款未明确具体仲裁机构（如仅写“提交当地仲裁委”），可能因约定不明导致仲裁协议无效，此时可向法院起诉。

2. 放弃仲裁协议：

   • 双方当事人可以通过明示或默示的方式放弃仲裁协议。例如，在仲裁程序启动前，双方一致同意将争议提交法院解决，或者以实际行动表明不再履行仲裁协议，那么此时当事人可以向法院起诉。
   • 注意：一方当事人向法院起诉时未声明有仲裁协议，且另一方在首次开庭前未对法院受理该案提出异议的，视为放弃仲裁协议，法院应当继续审理。

3. 仲裁裁决被撤销或不予执行：

   • 如果仲裁裁决作出后，该裁决被有管辖权的法院依法撤销或者裁定不予执行，那么当事人可以就该争议向法院提起诉讼。这是因为在这种情况下，仲裁裁决已经失去了法律效力，当事人需要通过其他途径解决争议。
   • 示例：某仲裁案中，仲裁员隐瞒关键证据导致裁决不公，当事人成功申请撤销裁决后向法院提起诉讼。

4. 仲裁程序存在严重瑕疵：

   • 如仲裁庭未保障当事人陈述权利、违反回避制度等，可能影响公正裁决。此时当事人可主张程序违法，请求法院介入。

四、建议与注意事项

1. 审查仲裁协议有效性：在签订合同时，应仔细审查仲裁协议的条款，确保其有效性并了解可能的例外情况。
2. 及时行使权利：在仲裁过程中，如果发现仲裁程序违法或仲裁裁决不公，应及时行使撤销权或申请不予执行，以维护自身权益。
3. 保留证据材料：完整保存合同、仲裁文书等证据，为后续法律程序提供支持。

综上所述，当事人在约定了有效的仲裁条款后，一般应通过仲裁解决争议。但在特定情况下，如仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人可以向法院提起诉讼。因此，在实际操作中，当事人应当根据具体情况灵活应对，确保自身权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。