在车辆事故中，当涉及到主次责任，且次要责任车辆出现报废情况时，保险公司的赔偿流程会遵循一定的原则和步骤。以下是对这一问题的详细解答：
一、责任比例划分
首先，需要明确的是，交通事故中的主次责任比例并非固定不变，而是根据事故的实际情况、双方的过错程度以及相关法律法规来确定的。一般来说，在机动车与机动车之间发生的事故中，主要责任方通常承担70%-80%的赔偿责任，次要责任方则承担20%-30%的赔偿责任。但具体比例可能会因地区、事故具体情况等因素有所差异。
二、保险赔偿顺序与范围
交强险赔偿：
- 无论责任大小，交强险都会在限额内先行赔偿对方的人身伤亡和财产损失。对于次要责任车辆报废的情况，交强险会首先赔偿对方车辆（如果对方车辆也有损失）以及对方人员的人身伤害费用，同时也会在财产损失限额内（通常为2000元）考虑赔偿次要责任车辆的部分损失（如果报废车辆的价值在限额内且符合赔偿条件）。但需要注意的是，交强险主要赔偿的是对方损失，对于自身车辆的损失，交强险是不赔偿的。
商业险赔偿：
- 如果车辆投保了商业车损险，那么对于次要责任车辆的报废损失，将由商业车损险在扣除免赔率（如果未投保不计免赔）后，按照责任比例进行赔偿。也就是说，如果次要责任方承担30%的责任，那么商业车损险将赔偿车辆报废损失的30%（在保险金额内）。
- 同时，如果对方车辆也有损失，且对方车辆的损失超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分将由商业三者险按照责任比例进行赔偿。
自费项目处理：
- 对于非医保用药、鉴定费等间接损失，这些通常不在保险范围内，需要按照责任比例由事故责任方自行承担。
三、具体赔偿流程示例
假设一起事故中，主要责任方车辆和次要责任方车辆发生碰撞，导致次要责任方车辆报废。事故总损失（包括两车维修费用、人员医疗费用等）为50万元。其中，次要责任方车辆报废损失为20万元。
交强险赔偿：
- 主要责任方交强险赔偿次要责任方人员医疗费用（假设为1.8万元，未超限额）和部分财产损失（假设为2000元，即交强险财产损失限额）。
商业险赔偿：
- 次要责任方车辆报废损失20万元，扣除交强险已赔偿的2000元后，剩余19.8万元。
- 假设商业车损险保险金额足够且未投保不计免赔（免赔率为0%），则商业车损险将赔偿19.8万元的30%（即次要责任比例），为5.94万元。
- 如果对方车辆也有损失，且超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分将由主要责任方的商业三者险按照70%的责任比例进行赔偿。
个人赔偿：
- 如果交强险和商业险仍不足以弥补次要责任方的全部损失（例如，如果次要责任方还承担了其他间接损失），那么剩余部分将由次要责任方自行承担。
四、注意事项
- 及时报案：事故发生后，应及时向保险公司报案，并保留好相关证据（如事故照片、医疗单据等），以便后续理赔。
- 了解保险条款：在投保时，应仔细阅读保险条款，了解保险赔偿的范围和限额，以便在事故发生时能够准确计算赔偿金额。
- 协商与诉讼：如果对于赔偿金额有争议，可以通过协商或诉讼的方式解决。在协商不成的情况下，可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。
综上所述，当车辆事故中次要责任车辆报废时，保险公司的赔偿将涉及交强险和商业险的多个方面，并需要按照责任比例进行计算。建议事故双方在处理此类事故时，及时咨询专业律师或保险机构以获取详细帮助和指导。