关于两兄弟宅基地争执中手写协议签字不盖手印是否起效的问题，结论是：手写协议签字不盖手印，在符合一定条件下，是可以起效的。以下从多个角度进行详细分析：

一、法律效力的基本原则

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为的有效要件主要包括：行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。对于手写协议而言，只要满足这些基本条件，即使不盖手印，也是具有法律效力的。签字作为行为人意思表示的一种方式，在法律上是被认可的。

二、签字与手印的法律效力对比

1. 签字：签字是行为人对其意思表示的一种确认方式，具有法律效力。在协议上签字，意味着行为人认可协议的内容，并愿意承担由此产生的法律后果。
2. 手印：手印在某些情况下可以作为身份确认的一种辅助手段，但并非法律行为的必要要件。在协议上按手印，可以进一步增强协议的真实性和可信度，但并非没有手印协议就无效。

三、手写协议签字不盖手印的具体分析

1. 如果协议内容合法、双方意思表示真实：即使协议是手写的，且只有签字没有盖手印，只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方签字时具有相应的民事行为能力，那么该协议就是有效的。
2. 如果协议内容存在违法或违背公序良俗的情况：或者双方签字时存在欺诈、胁迫等情形，导致意思表示不真实，那么即使协议上有签字（无论是否盖手印），该协议也是无效的。
3. 特殊情况下的考虑：在某些特殊情况下，如涉及重大财产权益或身份关系的协议，为了增强协议的真实性和可信度，可能会要求双方不仅签字还要按手印。但这并非法律强制要求，而是基于双方自愿和协商的结果。

四、建议与注意事项

1. 确保协议内容合法合规：在签订宅基地争执协议时，务必确保协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
2. 明确双方意思表示：双方在签订协议时，应确保意思表示真实、自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 考虑按手印以增强可信度：虽然按手印并非法律强制要求，但为了增强协议的真实性和可信度，双方可以考虑在协议上按手印。
4. 保留好协议原件：签订协议后，双方应妥善保管好协议原件，以备不时之需。

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