公司申请破产后，公司之前的协议处理方式需根据协议性质、履行情况及破产程序阶段综合判断，具体如下：

1. 协议性质决定处理原则

   • 待履行协议：若协议双方均未履行完毕（如长期供货合同、租赁合同），管理人（破产程序中的法定机构）有权决定继续履行或解除协议。
     
     • 继续履行：需管理人评估协议对破产财产增值的必要性，并通知对方继续履行，对方有权要求提供担保或提前支付价款。
       
     • 解除协议：若继续履行会损害债权人利益，管理人可单方解除，但需赔偿对方因解除产生的实际损失（以破产财产为限）。
       
   • 已履行完毕协议：若协议已履行完毕（如货物已交付、款项已支付），原则上不影响协议效力，但若存在欺诈、胁迫等可撤销情形，管理人可申请法院撤销。
     
   • 特殊协议：如涉及职工权益（劳动合同）、知识产权许可、金融衍生品等，需根据《企业破产法》及相关司法解释特殊处理（如劳动合同需优先清偿职工债权）。

2. 破产程序阶段影响协议效力

   • 破产申请受理前：协议效力不受影响，但若存在个别清偿（如破产申请前6个月内对个别债权人清偿），管理人可申请法院撤销。
     
   • 破产申请受理后：管理人接管公司财产和事务，所有协议均需经管理人审查，未经同意不得擅自履行或变更。

3. 协议相对方的权利救济

   • 继续履行请求权：若管理人决定继续履行协议，相对方有权要求管理人提供担保或提前支付价款。
     
   • 损害赔偿请求权：若协议被解除，相对方可申报债权，但赔偿范围仅限于实际损失（如已支付的货款、准备履行的费用），不包括预期利润。
     
   • 优先受偿权：若协议涉及特定财产（如抵押、质押），相对方有权就该财产优先受偿。

建议：若您是协议相对方，需密切关注破产程序进展，及时向管理人申报债权或主张权利；若您是公司方，需配合管理人审查协议，避免因擅自履行协议导致法律责任。具体操作需结合协议条款和破产程序细节，如有疑问可直接向我咨询。