结论：针对“小三和老公的来往流水太多，算不清楚怎么办，是否可以起诉”的问题，首先，流水多且算不清楚本身并不直接构成起诉的理由，但如果是涉及财产分割或追回赠与财产等法律问题，则可以通过法律途径解决；其次，是否可以起诉取决于具体的法律诉求和证据情况。以下从不同角度详细分析：
一、流水多且算不清楚的法律意义
流水多且算不清楚，在法律上并不直接构成一个独立的法律问题或起诉理由。流水记录本身只是交易或资金往来的凭证，其法律意义取决于这些流水背后的法律关系和目的。例如，如果流水记录显示的是夫妻共同财产被非法转移给第三者，那么这些流水记录就可能成为追回财产的重要证据。
二、可以起诉的情况及法律依据
追回赠与财产：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，归夫妻共同所有。如果一方未经另一方同意，擅自将夫妻共同财产赠与第三者，这种赠与行为是无效的，另一方有权要求第三者返还财产。
- 操作建议：收集所有可能的流水记录、转账凭证、聊天记录等证据，证明赠与行为的存在和财产的性质（即夫妻共同财产）。然后，可以向法院提起诉讼，要求第三者返还财产。
分割夫妻共同财产：
- 法律依据：在离婚时，夫妻双方有权要求分割共同财产。如果流水记录显示一方在婚姻关系存续期间有隐藏、转移、变卖、毁损夫妻共同财产的行为，另一方可以要求对该方少分或不分财产。
- 操作建议：同样需要收集流水记录等证据，证明对方存在上述行为。在离婚诉讼中，向法院提出分割财产的请求，并要求对方少分或不分财产。
三、无法直接起诉流水多且算不清楚的情况
如果流水记录只是显示双方有频繁的资金往来，但没有涉及非法转移或赠与夫妻共同财产等法律问题，那么仅凭流水多且算不清楚这一事实，是无法直接起诉的。因为法律起诉需要明确的法律诉求和相应的证据支持。
四、建议与注意事项
- 收集证据：无论是追回赠与财产还是分割夫妻共同财产，都需要收集充分的证据来支持自己的诉求。流水记录、转账凭证、聊天记录等都是重要的证据来源。
- 咨询专业律师：在处理这类复杂的法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和操作方案。
- 保持冷静与理性：在处理婚姻家庭纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的决策和行动，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
最后，如果你在处理这类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专注于婚姻家庭领域的专业律师，我将竭诚为你提供全面、准确的法律咨询和解决方案。