信用卡恶意透支立案后，通常不可以由当事人直接申请撤案，但存在一些特殊情形可能导致案件被撤销或终结诉讼程序。以下从法律规定、实践操作及注意事项三个角度为你详细分析：
一、法律规定角度
公诉案件性质：
- 信用卡恶意透支，若达到一定金额（如5万元以上），可能构成信用卡诈骗罪，属于刑事公诉案件。此类案件由检察机关代表国家提起刑事诉讼，旨在维护社会秩序、保障金融安全及确保法律的公正实施。因此，被害人（即银行）不能随意撤案。
法定撤案情形：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件：
- 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
- 犯罪已过追诉时效期限的；
- 经特赦令免除刑罚的；
- 犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
- 其他法律规定免予追究刑事责任的。
- 若信用卡恶意透支案件符合上述情形之一，司法机关有可能作出撤案决定。但需注意，这些情形均较为特殊，实践中较少出现。
二、实践操作角度
司法机关裁量权：
- 在实践中，司法机关会综合考量案件的具体情况，如犯罪情节的严重程度、犯罪嫌疑人的认罪态度、退赃退赔情况等。若犯罪情节确实比较轻微，且犯罪嫌疑人积极退赃、认罪悔罪，司法机关有可能根据法律规定和刑事政策，作出相对不起诉等决定，这在实际效果上类似于“撤案”。
特殊情况处理：
- 在侦查阶段，如果发现犯罪嫌疑人并非实施恶意透支行为的人，或有证据证明其行为不构成信用卡诈骗罪，公安机关可以撤销案件。
- 在审查起诉阶段，检察院若认为案件证据不足或存在其他不适合起诉的情况，可能会作出不起诉决定，从而终结案件。
和解与赔偿：
- 被害人与嫌疑人达成和解，并积极赔偿损失取得谅解，虽可作为量刑时从轻考虑的情节，但并不能直接导致案件撤销。撤案的决定权在司法机关手中，需根据具体案件事实和法律规定来判断。
三、注意事项
社会危害性：
- 信用卡恶意透支行为侵害了金融秩序和他人财产权益，具有较大的社会危害性。因此，司法机关在处理此类案件时通常会较为谨慎，不会轻易撤案。
犯罪记录保存：
- 即便在特定情况下可以撤案，信用卡诈骗罪的犯罪记录也会长久保存且不可撤销修改。这将对犯罪嫌疑人的个人信用和未来生活产生一定影响。
积极应对建议：
- 若你或你认识的人因信用卡恶意透支被立案，建议尽快采取以下措施：
- 积极履行还款义务：尽快还清透支本金、利息及滞纳金，体现悔罪态度。
- 与银行协商和解：主动联系银行说明情况，争取达成还款协议并取得书面谅解书。
- 配合司法机关调查：如实供述行为，主动退赃退赔，以减轻刑事责任。
总结来说，信用卡恶意透支立案后撤案并非易事，需严格遵循法律规定和司法程序。若你或你认识的人面临此类情况，建议充分了解相关法律知识，积极配合司法机关的调查工作，并根据实际情况寻求合适的法律救济途径。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。