当协议约定与法律规定发生抵触时，主要会产生以下法律后果：
协议条款无效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，如果协议中的某项约定与法律、行政法规的强制性规定相抵触，那么该条款将被视为无效。这意味着，该条款自始不具有法律约束力，双方当事人不能依据该条款主张权利或履行义务。
- 举例：假设双方签订了一份买卖合同，其中约定“买方在收到货物后无需支付货款”，这一约定明显违反了《民法典》中关于买卖合同支付价款的规定，因此该条款无效。
法律后果的承担：
- 当协议条款因与法律抵触而无效时，双方当事人需要依据法律规定来承担相应的法律后果。这可能包括返还财产、赔偿损失等。具体承担方式将根据无效条款的性质、对双方当事人的影响以及法律规定来确定。
- 举例：在上述买卖合同案例中，由于买方无需支付货款的条款无效，买方仍然需要按照法律规定支付货款。如果买方已经基于无效条款未支付货款，且卖方因此遭受了损失，买方可能需要承担赔偿损失的责任。
协议其他部分的效力：
- 协议中的某项条款无效，并不意味着整个协议都无效。如果协议的其他部分不违反法律、行政法规的强制性规定，且能够独立存在，那么这些部分仍然具有法律效力。双方当事人应当继续履行这些有效的条款。
- 举例：在一份包含多个条款的合同中，如果只有其中一个条款因与法律抵触而无效，而其他条款均合法有效，那么双方当事人应当继续履行其他有效的条款。
法律适用与争议解决：
- 当协议约定与法律规定发生抵触时，双方当事人应当依据法律规定来解决争议。如果双方无法协商一致，可以通过诉讼或仲裁等方式来寻求法律救济。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将依据法律规定来裁决争议，并确定双方当事人的权利和义务。
- 建议：在签订协议时，双方当事人应当仔细审查协议条款，确保它们不与法律、行政法规的强制性规定相抵触。如果发现任何抵触之处，应当及时修改或删除相关条款，以避免潜在的法律风险。
总结与建议：协议约定与法律规定抵触时，主要会导致相关条款无效、法律后果的承担、协议其他部分效力的存续以及法律适用与争议解决等问题。因此，在签订协议时，务必确保协议内容合法合规，避免与法律、行政法规的强制性规定相抵触。如果遇到相关问题，可以直接向我咨询，我将根据具体情况为你提供专业的法律建议。