结论前置：公司章程里设经理，实际为总经理是可以的，但需确保符合公司章程规定及法律要求，并注意相关法律后果。

详细分析如下：

1. 法律层面分析：

   • 根据《公司法》的相关规定，有限责任公司可以设立经理（通常称为总经理），这一职位的设立与解聘均由董事会决定。经理需对董事会负责，并行使相应的职权。这表明，在法律上，对于经理（总经理）的称谓并非固定不变，而是可以根据公司的实际情况和需求进行设定。只要公司章程中明确规定了经理的职权和职责，且该设置不违反法律法规的强制性规定，那么实际中将经理称为总经理是可行的。
   • 对于股份有限公司，虽然其规模较大、运营相对复杂，但同样地，法律并未强制要求必须设立总经理职位。股份有限公司可以根据自身情况，在公司章程中明确经理的职权和职责，并决定是否将其称为总经理。

2. 公司章程与实际操作的一致性：

   • 公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的基本制度和治理结构。如果公司章程中明确规定了设立经理职位，并详细描述了其职权和职责，那么在实际操作中，公司可以将该经理职位称为总经理，只要这一称谓不与公司章程的规定相冲突，且不影响经理职权的正常行使。
   • 然而，如果公司章程中并未明确规定经理可以称为总经理，或者存在其他限制性条款，那么公司在实际操作中应谨慎使用总经理这一称谓，以避免引发不必要的法律纠纷。

3. 可能的法律后果与建议：

   • 如果公司章程中未明确规定经理可以称为总经理，但公司实际中却这样称呼，且未引发任何法律纠纷或争议，那么从法律实践的角度来看，这种做法可能并不会受到法律的制裁。但是，为了避免潜在的法律风险，建议公司在修改公司章程时，明确经理的称谓和职权范围，以确保公司治理结构的清晰和稳定。
   • 另外，如果公司因称谓问题而引发法律纠纷或争议，那么公司可能需要承担相应的法律责任。例如，如果因称谓不清而导致合同履行出现问题或产生其他经济损失，公司可能需要承担赔偿责任。因此，建议公司在实际操作中谨慎使用称谓，并确保与公司章程的规定保持一致。

总结与建议： 公司章程里设经理，实际为总经理是可以的，但需确保符合公司章程规定及法律要求。为了避免潜在的法律风险，建议公司在修改公司章程时明确经理的称谓和职权范围。如果您在公司治理结构或法律合规方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。