伴侣通常不可以起诉单位侵犯夫妻共同财产。下面我将详细解释这一结论：

首先，我们要明确工资属于劳动者的个人收入，单位按照约定将工资发放给职工，是履行劳动合同的行为。在这个过程中，单位并不直接涉及职工与其伴侣之间的财产关系。

其次，伴侣对于职工的工资收入享有的是基于婚姻关系的共同财产权，但这并不意味着伴侣有权对单位发放工资的方式提出异议或进行干预。单位发放工资的方式（如使用两个工资卡）通常是基于单位内部的管理规定或操作习惯，并不直接构成对夫妻共同财产的侵犯。

最后，如果伴侣认为职工的某些行为（如隐瞒工资收入）侵犯了夫妻共同财产权，那么伴侣应当通过婚姻家庭内部的法律途径（如协商、调解、诉讼等）来解决，而不是直接起诉单位。

综上所述，伴侣通常不可以起诉单位侵犯夫妻共同财产。如果伴侣对夫妻共同财产有疑虑或争议，建议通过合法途径与职工进行协商或寻求法律援助。