企业扣押员工合同是违法的。以下从多个角度为您详细分析：

一、法律明确规定

根据《中华人民共和国劳动合同法》第十六条的规定，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本应当由用人单位和劳动者各执一份。这意味着，劳动者和用人单位在劳动合同文本上享有平等的持有权利，企业扣押员工合同的行为直接违反了这一法律规定。

二、违法行为的法律后果

1. 行政处罚：如果企业扣押劳动合同，劳动行政部门有权责令其改正，并可能根据情节轻重给予相应的行政处罚。虽然直接的罚款条款可能并未明确提及扣押劳动合同，但此类行为通常会被视为违反劳动法律法规，从而受到相应的行政处罚。
2. 民事责任：企业扣押劳动合同还可能侵犯劳动者的合法权益，如影响劳动者在面临劳动争议时提供证据的能力。如果因此给劳动者造成损失，企业可能需要承担赔偿责任。

三、劳动者的救济途径

1. 要求归还合同：劳动者有权要求企业归还被扣押的劳动合同。这是劳动者维护自己合法权益的直接方式。
2. 投诉举报：如果企业拒绝归还劳动合同，劳动者可以向当地的劳动行政部门投诉，请求劳动监察部门责令企业改正其违法行为。劳动监察部门有权对企业进行调查，并根据调查结果采取相应的行政措施。
3. 法律诉讼：在必要时，劳动者还可以通过法律诉讼的方式维护自己的权益。例如，如果因企业扣押劳动合同导致劳动者在劳动争议中无法提供证据而遭受损失，劳动者可以提起诉讼要求企业赔偿。

四、实际案例与启示

在实际操作中，已经有多起企业因扣押劳动合同而被劳动行政部门处罚的案例。这些案例表明，企业扣押劳动合同的行为不仅违法，而且可能面临严重的法律后果。因此，企业应当严格遵守法律法规，确保劳动合同的合法签订和有效执行。

五、建议与防范措施

1. 企业应增强法律意识：企业应当加强对劳动法律法规的学习和理解，确保自己的行为符合法律规定。特别是要避免扣押劳动合同等违法行为的发生。
2. 建立合规管理制度：企业应建立健全的内部管理制度，明确劳动合同的签订、保管和交付等流程，确保劳动合同的合法管理和使用。
3. 劳动者应提高警惕：劳动者在签订劳动合同时，应当仔细阅读合同条款，并确保自己持有一份合同文本。如果发现企业扣押劳动合同等违法行为，应及时向劳动行政部门投诉或寻求法律帮助。

综上所述，企业扣押员工合同是违法的行为，不仅违反了法律法规，还可能损害劳动者的合法权益。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议和帮助。