合同上写明“三日内付款合同生效”的条款，在符合法律规定的情况下，是具有法律效力的。以下从不同角度进行分析：

1. 合同生效的一般规定
   根据《民法典》第五百零二条，依法成立的合同，自成立时生效，但法律另有规定或当事人另有约定的除外。因此，合同生效时间可由双方自行约定，只要约定不违反法律强制性规定或公序良俗，即有效。

2. “三日内付款合同生效”条款的效力

   • 若条款明确且双方自愿：该条款属于附生效条件的约定（以付款行为作为生效条件），符合《民法典》第一百五十八条“民事法律行为可以附条件”的规定，合法有效。
     
   • 若条款存在歧义或显失公平：例如，条款未明确“三日”的起算时间（如从合同签订之日、收到合同之日还是其他时间起算），或要求一方在未付款前承担不合理义务，可能因条款不明确或显失公平被认定无效或可撤销。

3. 实务中的注意事项

   • 明确起算时间：建议在合同中补充“三日”的具体起算点（如“自合同签订之日起三日内”），避免争议。
     
   • 区分“生效”与“履行”：若条款仅约定“三日内付款合同生效”，但未约定付款义务本身（如付款金额、方式），可能需结合其他条款综合判断合同是否已具备履行内容。
     
   • 例外情形：若合同涉及需审批、登记等法定生效要件的（如中外合资经营企业合同），仅约定“付款生效”可能无法对抗法定要求，仍需完成审批或登记程序。

建议：若您拟签订或已签订此类合同，可进一步审查条款是否明确、权利义务是否对等，必要时补充约定或咨询专业律师完善条款。如有具体合同文本或场景，可直接向我咨询，我会结合细节为您分析。