关于店里（或单位）实行的“淘汰制”是否合法的问题，这主要取决于该制度的具体实施方式和相关法律法规的遵循情况。

首先，我们需要明确一点：劳动者在用人单位的绩效考核中居于末位，并不能直接等同于“不能胜任工作”。这是两个不同的概念。绩效考核末位可能只是表示在该次考核中，该劳动者的业绩相对于其他同事稍差，但并不意味着其无法胜任其工作岗位。

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，如果用人单位想要单方面解除劳动合同，必须符合法定的条件。其中，关于劳动者不能胜任工作的情况，法律有明确的规定：即使劳动者不能胜任工作，用人单位也应当先为其提供培训或者调整工作岗位的机会。只有在经过培训或者调整工作岗位后，劳动者仍然不能胜任工作的，用人单位才可以解除劳动合同。

现在，我们回到“淘汰制”的问题上。如果店里（或单位）仅仅因为劳动者在绩效考核中居于末位，就直接解除劳动合同，而不提供培训或调整岗位的机会，那么这种做法是不符合法律规定的。即使店里（或单位）支付了经济补偿，也不能改变其违法解除劳动合同的事实。

因此，店里（或单位）实行的“淘汰制”，如果仅仅以绩效考核末位作为解除劳动合同的依据，而不提供培训或调整岗位的机会，那么这种制度是不合法的。

为了确保员工的权益得到保障，建议店里（或单位）在制定和实施相关制度时，务必遵循相关法律法规的规定，确保制度的合法性和合理性。同时，员工在面对不合理的制度时，也有权向相关部门进行投诉和维权。