关于药店（或更广泛地说，任何用人单位）实行“末位淘汰制”是否合法的问题，这主要取决于具体的实施方式和是否符合相关法律法规的规定。

首先，我们需要明确的是，我国法律并未允许用人单位仅因劳动者的业绩表现在单位考核中居于末尾，就直接解除劳动关系。根据《劳动合同法》第三十九条、第四十条、第四十一条的规定，用人单位单方解除劳动关系的情形是法定的，必须满足特定的条件，如劳动者严重违反用人单位的规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害、不能胜任工作经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任等。而“末位淘汰制”仅仅基于考核排名，并不直接等同于劳动者不能胜任工作或存在其他法定解除劳动关系的情形。

其次，如果用人单位试图以“末位淘汰”为由直接解除劳动关系，这很可能构成违法解除劳动关系，劳动者有权依法维护自己的权益，包括要求用人单位继续履行劳动合同、支付赔偿金等。

然而，这并不意味着“末位淘汰制”本身完全不可行或不合理。如果用人单位能够制定清晰、科学的绩效考核方案，并且绩效考核标准做到公正、公平、公开，同时明确不能胜任工作的具体标准，并在充分征求员工意见的基础上，经过职工代表大会讨论后实施，那么对于确实不能胜任工作而居于考核末位者，用人单位可以在履行法定程序后，依法行使解除权。但这样的操作需要非常谨慎，并且必须确保所有程序都符合法律法规的规定。

具体到药店这一行业，由于药店的工作性质可能涉及药品销售、顾客服务等多个方面，绩效考核的标准和方式需要更加细致和科学。如果药店想要实施“末位淘汰制”，必须确保该制度不会侵犯劳动者的合法权益，不会仅因排名就轻易解除劳动关系，而是应该作为激励员工提升业绩、优化服务的一种手段，同时配合其他管理措施，如培训、辅导、岗位调整等，来帮助员工提升能力，避免被淘汰。

综上所述，药店实行“末位淘汰制”本身并不直接违法，但关键在于如何实施以及是否符合相关法律法规的规定。建议药店在实施前咨询专业法律人士或劳动部门，确保制度的合法性和合理性。