工厂保密协议盖行政章通常是生效的，但具体还需结合协议内容、盖章行为是否符合公司章程及法律规定等因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、行政章的法律效力
行政章，通常指的是公司公章，是公司处理对外事务，如签订合同、出具证明等时的法定印章。根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，公司公章具有法律效力，代表公司的意志。因此，在保密协议上加盖公司公章，一般可以视为公司对该协议内容的认可和承诺，协议因此具备法律效力。
二、保密协议生效的其他条件
虽然加盖公章是保密协议生效的重要条件之一，但并非唯一条件。保密协议的生效还需满足以下条件：
协议内容合法：保密协议的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗，不得侵犯他人的合法权益。例如，协议中不得约定过度的保密义务，或者要求员工承担不合理的违约责任等。
双方意思表示真实：保密协议的签订必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时存在重大误解或者显失公平的情况，该协议可能因可撤销而无效。
协议形式合规：除了加盖公章外，保密协议的形式也可能需要符合特定的要求。例如，某些情况下可能需要双方签字、盖章并注明签订日期等。不过，在大多数情况下，只要加盖了公司公章，且协议内容合法、双方意思表示真实，协议的形式要求通常可以得到满足。
三、特殊情况下的考虑
公司章程或内部规定：有些公司可能在公司章程或内部规定中对公章的使用有特别限制或要求。如果保密协议的签订违反了这些规定，可能会影响协议的效力。但这种情况通常较为少见，且需要具体分析公司章程或内部规定的具体内容。
盖章行为的授权：如果盖章行为未经公司合法授权，例如由非公司法定代表人或未经授权的人员擅自加盖公章，那么该盖章行为可能无效，进而影响保密协议的效力。因此，在签订保密协议时，应确保盖章行为已经得到了公司的合法授权。
四、法律建议
确保协议内容合法合规：在签订保密协议前，应仔细审查协议内容，确保其符合法律法规的规定，不侵犯他人的合法权益。
明确双方权利义务：保密协议应明确双方的权利义务，包括保密信息的范围、保密期限、保密义务的具体内容以及违约责任等。
确保盖章行为合法有效：在签订保密协议时，应确保盖章行为已经得到了公司的合法授权，且加盖的是公司公章或其他有效印章。
保留相关证据：为了应对可能出现的纠纷，建议保留与保密协议签订相关的证据，如会议记录、授权文件、盖章记录等。
如果你在签订或执行保密协议过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。