结论：公司员工在不知情的情况下帮助领导套取公司资金，是否构成犯罪需根据具体情况判断，关键在于员工是否具有犯罪故意及是否实施了犯罪行为。以下从不同角度进行分析：
一、员工不知情且无犯罪故意的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪的成立需要同时满足主观要件和客观要件。主观要件指的是犯罪故意或过失，客观要件则是指实施了犯罪行为。
- 在职务侵占罪或挪用资金罪等经济犯罪中，通常要求行为人具有非法占有或挪用公司资金的目的，并实施了相应的行为。
分析说明：
- 如果员工确实不知情，且没有与领导共谋或协助领导实施套取资金的行为，那么员工在主观上缺乏犯罪故意，客观上也没有实施犯罪行为。
- 在这种情况下，员工通常不构成犯罪，因为缺乏犯罪构成的主观和客观要件。
可能后果：
- 员工不会被追究刑事责任，但可能需要配合公司或司法机关的调查，提供相关证据或说明情况。
二、员工虽不知情但实施了协助行为的情况
法律背景：
- 即使员工不知情，但如果其实施了协助领导套取资金的行为，如提供账户、签字等，且这些行为在客观上促进了犯罪的发生，那么员工可能因“帮助行为”而涉及犯罪。
- 然而，这通常要求员工在实施行为时应当意识到自己的行为可能涉及违法犯罪，或者存在过失（如疏忽大意导致被利用）。
分析说明：
- 如果员工在实施协助行为时确实不知情，且没有过失，那么其可能不构成犯罪。但这种情况较为罕见，因为通常协助行为会伴随着一定的注意义务。
- 如果员工在实施协助行为时存在过失，如未对领导的要求进行合理审查或询问，那么可能因过失而涉及犯罪，但通常这种过失犯罪的处罚会相对较轻。
- 特殊情况：如果员工被领导欺骗或利用，且领导刻意隐瞒了真实目的，员工在完全不知情的情况下实施了协助行为，且没有过失，那么员工通常不构成犯罪。但这种情况需要充分的证据来证明员工的无知情和无过失。
可能后果：
- 如果员工被认定构成犯罪，可能面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。但具体处罚会根据犯罪情节、员工的作用大小等因素进行综合考量。
- 如果员工不构成犯罪，但存在过失或疏忽，可能面临公司内部的纪律处分或民事赔偿等后果。
三、建议与措施
对于员工：
- 在工作中应保持警惕，对领导或同事的要求进行合理审查和询问，避免被利用或陷入违法犯罪的境地。
- 如果发现领导或同事存在违法犯罪行为，应及时向公司或司法机关报告，以维护自身权益和公司利益。
对于公司：
- 应建立健全的内部控制制度，加强对公司资金的管理和监督，防止类似事件的发生。
- 一旦发现员工涉及违法犯罪行为，应及时报警并配合司法机关的调查工作，同时根据公司规定对涉事员工进行处理。
最后，公司员工在不知情的情况下帮助领导套取公司资金是否构成犯罪，需根据具体情况判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。